• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

Chemical synthesis of protein via simultaneous ligation of multiple peptide segments on DNA scaffold

Research Project

Project/Area Number 18K05313
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

林 剛介  名古屋大学, 工学研究科, 准教授 (40648268)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsタンパク質化学合成 / ペプチド連結反応 / DNA templated chemistry
Outline of Annual Research Achievements

2020年度は、(1)2019年度に開発したチオエステル前駆体をさらに発展させたCP-Thd(チアゾリジノン)ペプチドの開発に成功し、(2)またこれを用いたDNA上でのペプチド連結反応を開発した。(1)に関しては、チオエステル前駆体として機能することが知られている「Cys-Pro-脱離基」構造の脱離基にチアゾリジノン構造を持つCP-Thdペプチドの開発を行った。チアゾリジノン構造は、ペプチド固相合成中に導入されるCys残基から樹脂上で定量的に誘導することが可能であり、また固相合成後に液相で迅速かつ定量的にチオエステルへと変換可能であることを明らかにした。CP-Thdペプチドは、これまで開発されたN-Sアシルシフト型チオエステル前駆体としては、最も高効率にチオエステルへと変換可能な分子となった。最終的には、CP-Thdペプチドを用いてヒストンH3タンパク質のワンポット化学合成に成功し、Org.Lett誌へ報告している。(2)に関しては、ペプチド-DNAコンジュゲートをCP-Thdペプチドと一本鎖DNAをクリック反応によって作製し、DNA上でのペプチド連結反応を行ったところ、サブuM(マイクロモラー)という、通常のペプチド連結反応が全く進行しないような低濃度条件でペプチド連結反応が進行することが明らかとなった。さらに、ペプチド連結反応にはチオール触媒を添加する必要がないため、その後の脱硫反応までワンポットで行うことが可能であることが明らかとなった。チオエステルとCys間のペプチド連結反応であるNCL(native chemical ligation)をここまで低濃度で実現したのは本研究が初めてである。

  • Research Products

    (11 results)

All 2021 2020

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Organoruthenium-catalyzed chemical protein synthesis to elucidate the functions of epigenetic modifications on heterochromatin factors2021

    • Author(s)
      Kamo Naoki、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Murakami Hiroshi、Hayashi Gosuke、Okamoto Akimitsu
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 12 Pages: 5926~5937

    • DOI

      10.1039/d1sc00731a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] cDNA TRAP display for rapid and stable in vitro selection of antibody-like proteins2021

    • Author(s)
      Kondo Taishi、Eguchi Minori、Kito Seita、Fujino Tomoshige、Hayashi Gosuke、Murakami Hiroshi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 57 Pages: 2416~2419

    • DOI

      10.1039/d0cc07541h

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acetylation-modulated communication between the H3 N-terminal tail domain and the intrinsically disordered H1 C-terminal domain2020

    • Author(s)
      Hao Fanfan、Murphy Kevin J、Kujirai Tomoya、Kamo Naoki、Kato Junko、Koyama Masako、Okamato Akimitsu、Hayashi Gosuke、Kurumizaka Hitoshi、Hayes Jeffrey J
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 48 Pages: 11510~11520

    • DOI

      10.1093/nar/gkaa949

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] l-DNA-tagged fluorescence in situ hybridization for highly sensitive imaging of RNAs in single cells2020

    • Author(s)
      Ogata Motoyuki、Hayashi Gosuke、Ichiu Anri、Okamoto Akimitsu
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 18 Pages: 8084~8088

    • DOI

      10.1039/d0ob01635g

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antibody-like proteins that capture and neutralize SARS-CoV-22020

    • Author(s)
      Kondo T.、Iwatani Y.、Matsuoka K.、Fujino T.、Umemoto S.、Yokomaku Y.、Ishizaki K.、Kito S.、Sezaki T.、Hayashi G.、Murakami H.
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 6 Pages: eabd3916

    • DOI

      10.1126/sciadv.abd3916

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fmoc-Compatible and C-terminal-Sequence-Independent Peptide Alkyl Thioester Formation Using Cysteinylprolyl Imide2020

    • Author(s)
      Nakatsu Koki、Yanase Masafumi、Hayashi Gosuke、Okamoto Akimitsu
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 22 Pages: 4670~4674

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c01450

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Toolbox for chemically synthesized histone proteins2020

    • Author(s)
      Nakatsu Koki、Hayashi Gosuke、Okamoto Akimitsu
    • Journal Title

      Current Opinion in Chemical Biology

      Volume: 58 Pages: 10~19

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2020.04.016

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 修飾ヒストンの効率的化学合成法とヒストン動態解析2021

    • Author(s)
      林剛介
    • Organizer
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Presentation] タンパク質化学合成技術を駆使した修飾タンパク質の創製と生化学研究への展開2020

    • Author(s)
      林剛介
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] フィブロネクチンIII型ドメイン骨格を含むポリペプチド2020

    • Inventor(s)
      村上裕、都築成晃、近藤大志、林剛介、藤野公茂、築地真也、吉井達之
    • Industrial Property Rights Holder
      村上裕、都築成晃、近藤大志、林剛介、藤野公茂、築地真也、吉井達之
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      05512020JP
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 63.SARS-CoV-2 Binding Molecule2020

    • Inventor(s)
      村上裕、近藤大志、藤野公茂、林剛介、梅本駿、岩谷靖雅
    • Industrial Property Rights Holder
      村上裕、近藤大志、藤野公茂、林剛介、梅本駿、岩谷靖雅
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      WUS0001795
    • Overseas

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi