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2018 Fiscal Year Research-status Report

人工球状タンパク質超分子を用いたナノスケール相分離の実現とその応用

Research Project

Project/Area Number 18K05324
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

川上 了史  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (60566800)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsタンパク質ナノ粒子 / 超分子 / 自己組織化 / 相分離
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、これまでに設計と構築に成功してきた、中空人工タンパク質ナノ粒子TIP60を用いて、そのナノ粒子カプセルの内外で相分離を実現することにある。相分離の実現のため、親水性の高いタンパク質表面を疎水化する必要があった。しかし、直接的かつ部位特異的に化学修飾を行うのに適したシステイン残基がTIP60には一つも含まれていないことから、まず、そのシステイン導入変異体を設計する必要があった。対象とするのは、セリン残基である。TIP60の内外には多数のセリン残基が存在することから、構造的差異の小さいシステインを導入しても構造が壊れるといった可能性は低いことが予想された。そこで、これまでに精製に成功していた6つの変異体に1つのシステイン変異体を加えて、計7個の変異体の精製を行った。変異体については、非変性の電気泳動や動的光散乱を用いて、その構造が適切に保たれていることを確認した。一方、一部の変異体では、TIP60間でジスルフィド結合が生じていることをすでに明らかにしていたものの、TIP60の分子内部でジスルフィドが生じている可能性については未検討であった。特に化学修飾の際にはジスルフィド結合が形成されていると、修飾効率が低下しうることから、これを確認する必要があった。想定した立体構造からは分子内ジスルフィド結合はないと考えていたが予想に反して、全ての変異体で、部分的に分子内部で形成されたジスルフィド結合の存在が電気泳動による分析で確認された。その後の実験で、これらのジスルフィド結合は実験操作で生じたアーチファクトであることを解明できた。そこで、全ての変異体について、化学修飾ができるか否かを検討した。その結果、カプセルの内外で、わずかに修飾速度が異なるものの、基本的には内外ともに化学修飾ができることを明らかにした。また、本件については、論文で発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本来、変異体について、TIP60の内側と外側に分けて、システインを複数導入した多重変異体の設計と構築を検討していた。しかし、実験の操作によって生じたアーチファクトであったものの、TIP60分子内でジスルフィド結合を形成していることが示唆される結果が得られたことで、その解明に想定以上の時間を要した。そのため、多重変異体の創製はやや遅れた。しかし、変異体をコードする遺伝子の獲得はできており、また、それ以降の課題としていた化学修飾の手法を確立できたことで、計画通りにTIP60の内外の修飾実験に着手できると考えている。

Strategy for Future Research Activity

多重変異体の精製系の確立に着手することや、その化学修飾実験を遂行する。特に、これまでは、蛍光色素など比較的水溶性が高いものでテストしてきたが、今後は、実際の総分離実現に向けた疎水性化合物を用いたシステイン残基の修飾を検討する。また、内側、あるいは外側一方だけを極端に疎水化することで、TIP60が破壊されるような現象が生じるか否かを確認する。まず、修飾速度も早く、精製系も確立された外側のシステインを対象として疎水化を行い、不溶化するか否かを検討する。仮に不溶化が進行すれば、これを有機溶媒へ抽出する系の確立を行う。

Causes of Carryover

本来、すべての変異体構築とその精製系を構築し、大量精製の目処が立つところまでを当該年度の計画としていたが、想定外の分子内ジスルフィド結合形成が生じたことで、その解明のために大量精製系までの確立が困難となった。そこで、大量精製系を翌年度以降の課題とし、当該年度は本研究の障害になりうる分子内ジスルフィド結合形成の機構解明に時間を当てた。こちらは、少量のスケールで実験実施が可能であったことで、次年度使用額が生じる理由となった。

  • Research Products

    (11 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Design of Hollow Protein Nanoparticles with Modifiable Interior and Exterior Surfaces2018

    • Author(s)
      Kawakami Norifumi、Kondo Hiroki、Matsuzawa Yuki、Hayasaka Kaoru、Nasu Erika、Sasahara Kenji、Arai Ryoichi、Miyamoto Kenji
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 57 Pages: 12400~12404

    • DOI

      10.1002/anie.201805565

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アニオン性タンパク質ナノ粒子 TIP60 とカチオン性タンパク質 の相互作用解析2019

    • Author(s)
      川上了史、那須英里圭、宮田健、宮本憲二
    • Organizer
      日本化学会 第99春季年会
  • [Presentation] 人工タンパク質ナノ粒子 TIP60 の可逆的な化学修飾2019

    • Author(s)
      那須英里圭・川上了史・宮本憲二
    • Organizer
      日本化学会 第99春季年会
  • [Presentation] Design of a fusion protein forming mutation tolerant and chemically modifiable hollow nanoparticle2018

    • Author(s)
      Norifumi Kawakami, Hiroki Kondo, Yuki Matsuzawa, Erika Nasu, Kenji Miyamoto
    • Organizer
      32nd Annual Symposium of The Protein Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 人工中空蛋白質超分子TIP60と外部添加分子の相互作用解析2018

    • Author(s)
      川上了史、那須英里圭、宮本憲二
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] 切頂二十面体型人工タンパク質ナノ超分子TIP60のX線小角散乱解析2018

    • Author(s)
      笹原健嗣、川上了史、宮本憲二、新井亮一
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] 中空蛋白質ナノ粒子TIP60の構築2018

    • Author(s)
      川上了史
    • Organizer
      第31回生物無機化学夏季セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Catalytic activity of the alcohol dehydrogenase immobilized by the protein supramolecule, TIP602018

    • Author(s)
      Yuki Matsuzawa, Norifumi Kawakami, Kenji Miyamoto
    • Organizer
      第20回生体触媒化学シンポジウム
  • [Presentation] Enzyme immobilization in protein aggregates composed of a protein nanoparticle, TIP602018

    • Author(s)
      Norifumi KAWAKAMI
    • Organizer
      The International Symposium on Bioinorganic Chemistry 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] タンパク質でナノスケールのサッカーボール型分子を創出

    • URL

      https://www.keio.ac.jp/ja/press-releases/2018/9/6/28-47911/

  • [Remarks] Creating Nanoscale Soccer Ball-shaped Molecules

    • URL

      https://www.keio.ac.jp/en/press-releases/2018/Oct/5/49-48663/

URL: 

Published: 2019-12-27  

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