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2018 Fiscal Year Research-status Report

エポキシシクロヘキセンジオン類によるADP/ATP輸送体の凝集メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 18K05458
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村井 正俊  京都大学, 農学研究科, 准教授 (80543925)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 武範  徳島大学, 先端酵素学研究所(プロテオ), 講師 (80457324)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsミトコンドリア / ADP/ATP輸送体 / 阻害剤 / ケミカルバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

ミトコンドリアADP/ATP輸送体(AAC)は、ミトコンドリア内膜上でADPとATPの交換反応を行う分子質量約30 kDaの膜輸送体であり、マトリックス側で生産されたATPを細胞質へ供給する役割を担っている。ウシ心筋ミトコンドリアAACの新規阻害剤を探索する過程で、epoxycyclohexenedione類(ECH類)がAACによる[14C]ADPの取り込みを阻害することを見出した。2018年度は、ECH類の作用機構を解明することを目指した。
ECH類は分子内に2箇所の求電子性反応点を持つため、AACの阻害には求核性アミノ酸残基との共有結合形成が関わっている可能性が高い。そこで、アルキル側鎖にクリックケミストリーを指向した末端アルキンを持つECHD誘導体を合成した(AMM-120)。ウシ心筋亜ミトコンドリア粒子(SMP)をAMM-120存在下でインキュベートし、2次タグとなる蛍光タグ(TAMRA-N3)をクリックケミストリーによって導入したところ、AACに相当するバンドに蛍光バが観察された。また、システイン修飾剤であるN-エチルマレイミドで、AAC表面上の3箇所のシステイン(Cys57, Cys160, Cys257)のうち、Cys57を選択的に修飾した場合、AMM-120による化学修飾が顕著に抑制されたことから、Cys57が主たる修飾部位であることが強く示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでの研究で、ECH類はAACに存在するシステイン残基と特異的に化学修飾することでAACを阻害することがわかった。また、後述の通り、高濃度のECH類でSMPを処理した場合、AACの顕著な凝集が誘導されるというユニークな現象を見出した。このような理由から、研究は概ね順調に推移していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

ECH類に関する特筆すべき現象として、より高濃度(50-100 micro-M)のECHD類でウシ心筋SMPを処理すると、還元・非還元条件に関わらずAACの顕著な凝集が誘導され、SDS-PAGEのゲル上からAAC単量体のバンドは完全に消失した。このような凝集誘導効果は、BKAやCATRでは認められない極めてユニークな現象である。ECHD類によるAAC選択的な凝集誘導は、NEM処理によって抑制されたため、システイン修飾に起因することが示唆された。以上の結果より、ECHD類は既知のAAC阻害剤とは異なる作用機構を有する新規なAAC阻害剤であることがわかった。

2019年度以降は、ECH類によるAACの凝集メカニズム解明に焦点を当てて研究を進める予定である。

Causes of Carryover

2018年度は、生化学実験の比率が多かったため、有機合成関係で計上した予算に余りが発生した。2019年度は実験における有機合成の割合が増える予定なので、余剰の予算を含めて計画的に使用したい。

  • Research Products

    (19 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Exploring the quinone/inhibitor-binding pocket in mitochondrial respiratory complex I by chemical biology approaches2019

    • Author(s)
      Uno S, Kimura H, Murai M and Miyoshi H
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 294 Pages: 679-696

    • DOI

      10.1074/jbc.RA118.006056

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pentenediol-type compounds specifically bind to voltage-dependent anion channel 1 in Saccharomyces cerevisiae mitochondria2019

    • Author(s)
      Unten Y, Murai M, Yamamoto T, Watanabe A, Ichimaru N, Aburaya S, Aoki W, Shinohara Y and Miyoshi H
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 58 Pages: 1141-1154

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b01209

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epoxycyclohexenedione-Type Compounds Make Up a New Class of Inhibitors of the Bovine Mitochondrial ADP/ATP Carrier2018

    • Author(s)
      Aoyama A, Murai M, Ichimaru, Aburaya S, Aoki W, and Miyoshi H
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 57 Pages: 1031~1044

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.7b01119

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iのキノン/阻害剤結合ポケットの構造特性の解明2019

    • Author(s)
      宇野晋平、木村洋則、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第44回大会
  • [Presentation] 呼吸鎖複合体-Iからの活性酸素を抑制する化合物群(S1QEL類)の作用機構研究2019

    • Author(s)
      馬場敦志、辻諄人、木村洋則、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第44回大会
  • [Presentation] エポキシシクロヘキセンジオン類によるミトコンドリアADP/ATP輸送体の凝集メカニズムの解明2019

    • Author(s)
      青山綾希、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 合成キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットの構造特性の解明2019

    • Author(s)
      宇野晋平、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] ペンテンジオール類は出芽酵母ミトコンドリアVDAC1を特異的に阻害する2019

    • Author(s)
      運天優歩、村井正俊、一丸直哉、山本武範、篠原康雄、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおけるアミロライド類の結合部位の同定2019

    • Author(s)
      木村洋則、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iからの活性酸素発生を抑制する化合物群(S1QEL類)の作用機構研究2019

    • Author(s)
      馬場敦志、辻諄人、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iのユビキノン結合ポケットの構造特性2018

    • Author(s)
      村井正俊、桝谷貴洋、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第43回大会
  • [Presentation] ミトコンドリアADP/ATP 輸送体の新規阻害剤エポキシシクロヘキセンジオン類の作用機構研究2018

    • Author(s)
      青山綾希、村井正俊、一丸直哉、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第43回大会
  • [Presentation] Epoxycyclohexenedione-type compounds make up a new class of inhibitors of the bovine mitochondrial ADP/ATP carrier2018

    • Author(s)
      Aoyama A, Murai M and Miyoshi, H
    • Organizer
      19th European Bioenergetics Conference (EBEC2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of the quinone-binding pocket of mitochondrial respiratory complex I through specific chemical modifications2018

    • Author(s)
      Murai M, Masuya T and Miyoshi H
    • Organizer
      19th European Bioenergetics Conference (EBEC2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ケミカルバイオロジーで紐解く呼吸鎖複合体-I のキノン結合ポケットの 構造特性2018

    • Author(s)
      村井正俊、宇野晋平、木村洋則、三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iの機能解明を目指した生物有機化学的研究:低分子化合物で紐解く巨大タンパク質の構造と機能2018

    • Author(s)
      村井正俊
    • Organizer
      有機化学研究会(白鷺セミナー)第84回講演会
    • Invited
  • [Remarks] Google Scholar

    • URL

      https://scholar.google.co.jp/citations?user=I66ybkoAAAAJ&hl=ja

  • [Remarks] 所属研究室ホームページ

    • URL

      http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp

  • [Remarks] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/read0145924/

URL: 

Published: 2019-12-27  

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