• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

Identification and characterization of DNA/RNA heteroduplex oligonucleotide cleaving enzyme

Research Project

Project/Area Number 18K05550
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

浅田 健  国立研究開発法人理化学研究所, 革新知能統合研究センター, 研究員 (70773414)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords核酸医薬 / 遺伝子発現制御
Outline of Annual Research Achievements

核酸医薬は、従来の低分子化合物や抗体医薬では困難な標的RNAの選択的制御を可能とする先端的なバイオ医薬技術である。核酸医薬は大きく分けてRNAを基盤としたsiRNAおよびmiRNA mimic(いずれも2本鎖RNA)とDNAを基盤としたデコイ(2本鎖DNA)、アンチセンス核酸(antisense oligonucleotides, ASO; 1本鎖DNA)、および当研究グループで開発したHDO(heteroduplex oligonucleotides, ヘテロ2本鎖核酸)に分類することができる。DNAを基盤とした核酸医薬では、ASOとして家族性高コレステロール血症に対するミポメルセン、脊髄性筋萎縮症に対するヌシルセンなどが承認されているが、これら以外にも多くの疾患で臨床試験が進行している。
Gapmer型のASO核酸医薬の作用メカニズムとしては、ASO鎖が標的mRNAに配列依存的に結合し、続いてRNase Hが2本鎖ASO/RNAを認識して標的mRNAを切断することよって、遺伝子の発現を制御することが知られている。ASOに関しては受容体、結合タンパク質、細胞内輸送機構や局在などを含めて、詳細な分子メカニズムが報告されているが、HDOに関してはどのようなタンパク質と結合するのか、どのように細胞質内で輸送されるのか、どのように2本鎖HDOから1本鎖ASOが分離されるのかなどを含めて、ほとんど解明されていなかった。
本研究ではHDOによる遺伝子発現制御の詳細な分子メカニズムを解明する事で、今後の核酸医薬の発展や、より適切なドラッグデザインおよびドラッグターケティングに貢献できると考え、HDOに結合するタンパク質の同定を試みた。本研究成果により、ANXA5, CA8, APEX1, FEN1タンパク質がHDOに結合し、かつ活性制御に関わることが明らかとなった。

Remarks

3月26日にNucleic Acids Researchより下記のアクセプトの連絡が届いた。
We are pleased to tell you that your manuscript has been accepted for publication in NAR.
但し、プレスリリースの調整を行なった為、公式上Editorial Decisionが3月26日、acceptが4月23日となった。

  • Research Products

    (20 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 9 results) Presentation (7 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Shadow Estimation for Ultrasound Images Using Auto-Encoding Structures and Synthetic Shadows2021

    • Author(s)
      Yasutomi Suguru、Arakaki Tatsuya、Matsuoka Ryu、Sakai Akira、Komatsu Reina、Shozu Kanto、Dozen Ai、Machino Hidenori、Asada Ken、Kaneko Syuzo、Sekizawa Akihiko、Hamamoto Ryuji、Komatsu Masaaki
    • Journal Title

      Applied Sciences

      Volume: 11 Pages: 1127~1127

    • DOI

      10.3390/app11031127

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Detection of Cardiac Structural Abnormalities in Fetal Ultrasound Videos Using Deep Learning2021

    • Author(s)
      Komatsu Masaaki、Sakai Akira、Komatsu Reina、Matsuoka Ryu、Yasutomi Suguru、Shozu Kanto、Dozen Ai、Machino Hidenori、Hidaka Hirokazu、Arakaki Tatsuya、Asada Ken、Kaneko Syuzo、Sekizawa Akihiko、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Applied Sciences

      Volume: 11 Pages: 371~371

    • DOI

      10.3390/app11010371

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Separation-related rapid nuclear transport of DNA/RNA heteroduplex oligonucleotide: unveiling distinctive intracellular trafficking2021

    • Author(s)
      Ono Daisuke、Asada Ken、Yui Daishi、Sakaue Fumika、Yoshioka Kotaro、Nagata Tetsuya、Yokota Takanori
    • Journal Title

      Molecular Therapy - Nucleic Acids

      Volume: 23 Pages: 1360~1370

    • DOI

      10.1016/j.omtn.2020.11.022

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Model-Agnostic Method for Thoracic Wall Segmentation in Fetal Ultrasound Videos2020

    • Author(s)
      Shozu Kanto、Komatsu Masaaki、Sakai Akira、Komatsu Reina、Dozen Ai、Machino Hidenori、Yasutomi Suguru、Arakaki Tatsuya、Asada Ken、Kaneko Syuzo、Matsuoka Ryu、Nakashima Akitoshi、Sekizawa Akihiko、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 1691~1691

    • DOI

      10.3390/biom10121691

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Application of Artificial Intelligence Technology in Oncology: Towards the Establishment of Precision Medicine2020

    • Author(s)
      Hamamoto Ryuji、Suvarna Kruthi、Yamada Masayoshi、Kobayashi Kazuma、Shinkai Norio、Miyake Mototaka、Takahashi Masamichi、Jinnai Shunichi、Shimoyama Ryo、Sakai Akira、Takasawa Ken、Bolatkan Amina、Shozu Kanto、Dozen Ai、Machino Hidenori、Takahashi Satoshi、Asada Ken、Komatsu Masaaki、Sese Jun、Kaneko Syuzo
    • Journal Title

      Cancers

      Volume: 12 Pages: 3532~3532

    • DOI

      10.3390/cancers12123532

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two Secreted Proteoglycans, Activators of Urothelial Cell-Cell Adhesion, Negatively Contribute to Bladder Cancer Initiation and Progression2020

    • Author(s)
      Papadaki Vasiliki、Asada Ken、Watson Julie K.、Tamura Toshiya、Leung Alex、Hopkins Jack、Dellett Margaret、Sasai Noriaki、Davaapil Hongorzul、Nik-Zainal Serena、Longbottom Rebecca、Nakakido Makoto、Torii Ryo、Veerakumarasivam Abhi、Kaneko Syuzo、Sagoo Mandeep S.、Murphy Gillian、Mitani Akihisa、Tsumoto Kohei、et al.
    • Journal Title

      Cancers

      Volume: 12 Pages: 3362~3362

    • DOI

      10.3390/cancers12113362

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Image Segmentation of the Ventricular Septum in Fetal Cardiac Ultrasound Videos Based on Deep Learning Using Time-Series Information2020

    • Author(s)
      Dozen Ai、Komatsu Masaaki、Sakai Akira、Komatsu Reina、Shozu Kanto、Machino Hidenori、Yasutomi Suguru、Arakaki Tatsuya、Asada Ken、Kaneko Syuzo、Matsuoka Ryu、Aoki Daisuke、Sekizawa Akihiko、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 1526~1526

    • DOI

      10.3390/biom10111526

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Predicting Deep Learning Based Multi-Omics Parallel Integration Survival Subtypes in Lung Cancer Using Reverse Phase Protein Array Data2020

    • Author(s)
      Takahashi Satoshi、Asada Ken、Takasawa Ken、Shimoyama Ryo、Sakai Akira、Bolatkan Amina、Shinkai Norio、Kobayashi Kazuma、Komatsu Masaaki、Kaneko Syuzo、Sese Jun、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 1460~1460

    • DOI

      10.3390/biom10101460

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Critical Roles of N6-Methyladenosine (m6A) in Cancer and Virus Infection2020

    • Author(s)
      Asada Ken、Bolatkan Amina、Takasawa Ken、Komatsu Masaaki、Kaneko Syuzo、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 1071~1071

    • DOI

      10.3390/biom10071071

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Uncovering Prognosis-Related Genes and Pathways by Multi-Omics Analysis in Lung Cancer2020

    • Author(s)
      Asada Ken、Kobayashi Kazuma、Joutard Samuel、Tubaki Masashi、Takahashi Satoshi、Takasawa Ken、Komatsu Masaaki、Kaneko Syuzo、Sese Jun、Hamamoto Ryuji
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 10 Pages: 524~524

    • DOI

      10.3390/biom10040524

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Uncovering Prognosis-related Genes and Pathways by Multi-omics Analysis in Lung Adenocarcinoma2020

    • Author(s)
      浅田健, 小林和馬, 高橋慧, 高澤建, 小松正明, 金子修三, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Clinical epigenetic analysis with robotics in ovarian cancer2020

    • Author(s)
      小松正明, 金子修三, 浅田健, 吉田裕, 加藤友康, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Intefrative multi-omics analysis of multistage tumorigenesis in high-grade serous ovarian cancer2020

    • Author(s)
      同前愛, 小松正明, 町野英徳, 中村康平, 金子修三, 生水貫人, 浅田健, 千代田達幸, 中山健太郎, 青木大輔, 京哲, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Biological mechanisms of PRELP in ovarian cancer2020

    • Author(s)
      生水貫人, 小松正明, 金子修三, 同前愛, 町野英徳, 中島彰俊, 齋藤滋, 浅田健, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Overexpression of METTL6 is involved in human hepatocellular carcinoma2020

    • Author(s)
      ボラトカン アミーナ, 金子修三, 浅田健, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] LKB1-MARK3 axis is a novel stress-activated cell cycle checkpoint and sysregulated in high-grade serous obarian cancer2020

    • Author(s)
      町野英徳, 金子修三, 小松正明, 浅田健, 同前愛, 生水貫人, 浜本隆二
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 肺がん予後予測を志向したマルチオミックス解析2020

    • Author(s)
      浅田健、小林和馬、高橋慧、高澤建、小松正明、金子修三、浜本隆二
    • Organizer
      第2回日本メディカルAI学会学術集会
  • [Book] 医学のあゆみ AIが切り拓く未来の医療2020

    • Author(s)
      浅田健, 浜本隆二
    • Total Pages
      919
    • Publisher
      医歯薬出版
  • [Remarks] 「 ヘテロ核酸医薬による遺伝子発現制御メカニズムを解明 」― より有効な核酸医薬のデザインが可能に

    • URL

      https://www.amed.go.jp/news/release_20210430-03.html

  • [Remarks] ヘテロ核酸医薬による遺伝子発現制御メカニズムを解明

    • URL

      https://www.tmd.ac.jp/topics_detail/id=20210430-1

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi