2023 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of seed detachment phenomenon in domestication using seed shattering gene in rice
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18K05575
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Research Institution | Kagawa University |
Principal Investigator |
小西 左江子 (杉田左江子) 香川大学, 農学部, 准教授 (10574634)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | イネ / 脱粒性 / 離層 / 栽培化 / ゲノム編集 |
Outline of Annual Research Achievements |
脱粒性とは、穂から種子が脱粒する性質であり、自然界では種子の拡散による繁殖戦略として重要な性質である。一方、作物として考えた場合、強い脱粒性は収 穫量の減少につながることから、今日でも重要な農業形質の1つである。今年度は継続研究を含む、以下の3つの項目について実施した。1.「イネの新規脱粒性遺 伝子の探索」:ガ ンマ線照射による変異体の中から選抜した脱粒性に関する突然変異系 統を用いて、後代で表現型および遺伝子型の確認を行った。また、同時 に野生型との交配 および世代促進を行い、F2種子を得た。F2個体を栽培し、脱粒性の分離 を調べた結果、表現型がおおよそ3:1に分離することが確認できた。 そこで、F2個体のう ち難脱粒性の表現型を示した個体由来のバルクDNAを作成し、次世代シー ケンサー解析を用いてMutmap解析を試みた。現在、シークエンス 解析データを用いて、 候補遺伝子の原因変異の確認を行っているところである。候補遺伝子につ いては、ゲノム編集を用いて、機能欠損型の変異体を作成し、 非常に脱粒しやすい機 能型qSH1領域を含むイネ品種日本晴背景NIL(qSH1)に導入することにより、 機能の証明を行う予定である。 2.「難脱粒性系統の脱粒性の 定量化」:機能型qSH1 領域を含むイネ品種日本晴背景NIL(qSH1)とその難脱粒性変異体系統を用いて、出穂直後から収穫期までについて1週間毎に穀粒脱粒性試験 装置を用いて脱粒性の 定量を行った。3.「難脱粒性系統の組織解剖学的解析」:機能型qSH1領域を含むイネ品種日本晴背景NIL(qSH1)とその難脱粒性変異体系統 を用いて、出穂直後の 種子基部の離層の組織解剖学的観察を行った。また、収穫後の穂を用いて電子顕微鏡により種子基部の微細構造を観察した。4. 「qSH1の 機能に重要なSNP周辺の改変」:ゲノム編集を用いてqSH1の機能に重要なSNPの改変を行うためのコンストラクトの作成を試みた。
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[Presentation] Sensory Taste Test of Rice Using a Good Tasting Variety Cultivated at the Faculty of Agriculture, Kagawa University2023
Author(s)
Nana Okada, Karin Okumura, Honoka Kaihara, Rinsei Tanimoto, Koichiro Nishikawa, Kota Matsuda, Akane Saka, Yuki Mizushima, Tomohiro Yoshida, Misa Kamimukai, Heenkenda Mudalige Aruna Sanjaya Bandara Jayasinghe, Izumi Ando, Saeko Konishi-Sugita
Organizer
Kagawa International Forum on Advanced Genomics, Environmental and Resource Genomics and Life Sciences II
Int'l Joint Research