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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of mechanism to induce potent neutralizing antibodies using SIV-infected macaques

Research Project

Project/Area Number 18K06032
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

桑田 岳夫  熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 特定事業教員 (70346063)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords中和抗体 / SIV / 遺伝子多型
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、SIV感染サル・モデルを用い、多様なHIV-1株を広範に中和する抗体(bnAb) B404に類似した抗体(B404-class抗体)誘導の解析を行った。前年度までの解析から、B404-class抗体は誘導は、B404-class抗体が使用する抗体重鎖遺伝子のVH3.33の多型と関連する可能性が示された。
本年度は、VH3.33遺伝子の多型がSIV Envへの結合・中和活性に及ぼす影響をあきらかにするため、B404抗体遺伝子を体細胞突然変異が起こる前のVH3.33遺伝子のET, VIのgermline配列に入れ替えた変異体を作成した。その結果、ETの配列に戻したB404変異体はSIVへの結合・中和活性を保持していたが、VIの配列に戻したB404変異体はSIV Envに結合せず、中和活性も無かった。一部をET, VIのgermline配列に戻したB404変異体の解析により、38V変異によってEnvへの結合や中和活性が消失し、38EがbnAb B404の誘導に重要であることがあきらかになった。
これらの変異体の解析に加え、6頭のSIV感染サルのリンパ節で発現している抗体遺伝子をNext generation sequencing (NGS)で解析した。その結果、これまでに分離したB404-class抗体とクラスターを形成する配列はB404-class抗体が誘導されたMM621からしか得られなかった。また、VH3.33 ET alleleを持つMM621では38E, 65Tを持ったVH3.33配列が多くみられたが、他の5頭のサルではほとんどみられなかった。
これらの結果は、bnAb B404の誘導がVH3.33遺伝子の多型によって決定されていることを強く示唆している。

  • Research Products

    (5 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] NIH, NIAID(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      NIH, NIAID
  • [Journal Article] Hybrids of Small-Molecule CD4 Mimics with Polyethylene Glycol Units as HIV Entry Inhibitors2021

    • Author(s)
      Kobayakawa Takuya、Tsuji Kohei、Konno Kiju、Himeno Ai、Masuda Ami、Yang Tingting、Takahashi Kohei、Ishida Yusuke、Ohashi Nami、Kuwata Takeo、Matsumoto Kaho、Yoshimura Kazuhisa、Sakawaki Hiromi、Miura Tomoyuki、Harada Shigeyoshi、Matsushita Shuzo、Tamamura Hirokazu
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry

      Volume: 64 Pages: 1481~1496

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.0c01153

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A Potent Anti-Simian Immunodeficiency Virus Neutralizing Antibody Induction Associated with a Germ Line Immunoglobulin Gene Polymorphism in Rhesus Macaques2021

    • Author(s)
      Matsuoka Saori、Kuwata Takeo、Ishii Hiroshi、Sekizuka Tsuyoshi、Kuroda Makoto、Sano Masato、Okazaki Midori、Yamamoto Hiroyuki、Shimizu Mikiko、Matsushita Shuzo、Seki Yohei、Saito Akatsuki、Sakawaki Hiromi、Hirsch Vanessa M.、Miura Tomoyuki、Akari Hirofumi、Matano Tetsuro
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 95 Pages: e02455-20

    • DOI

      10.1128/JVI.02455-20

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Existence of Replication-Competent Minor Variants with Different Coreceptor Usage in Plasma from HIV-1-Infected Individuals2020

    • Author(s)
      Maeda Yosuke、Takemura Taichiro、Chikata Takayuki、Kuwata Takeo、Terasawa Hiromi、Fujimoto Riito、Kuse Nozomi、Akahoshi Tomohiro、Murakoshi Hayato、Tran Giang Van、Zhang Yu、Pham Chau Ha、Pham Anh Hong Quynh、Monde Kazuaki、Sawa Tomohiro、Matsushita Shuzo、Nguyen Trung Vu、Nguyen Kinh Van、Hasebe Futoshi et al.
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 94 Pages: e00193-20

    • DOI

      10.1128/jvi.00193-20

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prediction of Contact Residues in Anti-HIV Neutralizing Antibody by Deep Learning2020

    • Author(s)
      Kaku Yu、Kuwata Takeo、Gorny Miroslaw K.、Matsushita Shuzo
    • Journal Title

      Japanese Journal of Infectious Diseases

      Volume: 73 Pages: 235~241

    • DOI

      10.7883/yoken.JJID.2019.496

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

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