2019 Fiscal Year Research-status Report
神経幹細胞の分化能を規定するDNAメチル化変動の解明
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18K06067
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| Research Institution | Keio University |
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Principal Investigator |
佐野坂 司 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (40588472)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | エピジェネティクス / DNAメチル化 / 神経幹細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
脳・神経系は発生段階依存的に性質の変化する神経幹細胞から分化した細胞で構成されるため、その成り立ちを理解するためには、どのようなメカニズムで神経 幹細胞の性質変化が引き起こされるかを知ることが非常に重要である。DNAメチル化といったエピジェネティックな変動が神経幹細胞の分化を制御していること が報告されているものの、DNAメチル化変動は領域特異的であり、どのような機構で領域特異的なメチル化変動が引き起こされているのかは未解明である。そこ で、本研究課題では、神経幹細胞の性質(各細胞種への分化能)を規定しているメチル化変動領域を同定するとともに、それら領域のメチル化変動を制御するメカ ニズムを解明することを目的とした。 本年度は、昨年度同定したメチル化が変動する領域において、ヒストン修飾（メチル化やアセチル化）の状態を解析することで、発生段階の進行に伴って変動するクロマチン状態を解析した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
NGSデータが登録されているデータベース(ChIP-Atlas等)を活用し、各種ヒストン抗体(H3K4me1, H3K4me3, H3K9me3, H3K27ac)を用いたChIP-SeqやATAC-Seqのデータを統合解析し、メチル化変動領域におけるクロマチン構造変化との関連を見出した。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでNFIを中心に解析を行ってきたが、複数の因子のコンビネーションが重要と思われる結果が出てきたため、これまでに同定した転写因子群よりNFI以外にも候補因子を絞り込み、それら因子とDNAメチル化変化との関連を解析する。
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| Causes of Carryover |
予定していたChIP-Seqのデータが公共のデータベースより得られた為、シーケンス費用が生じなかった。新たに同定した候補転写因子が複数ある為、そのChIP-Seqの費用に充てる。
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