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2019 Fiscal Year Research-status Report

Structural analysis of chaperone complex for the IgM assembly

Research Project

Project/Area Number 18K06075
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

渡部 聡  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (50432357)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords構造解析 / クライオ電子顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

免疫グロブリンM (IgM)は、二組の軽鎖と重鎖で形成されたIgM単量体が、ジスルフィド結合で架橋された五または六量体として細胞外に分泌される。これまでの 研究から、細胞の分泌経路において、小胞体で合成されたIgM単量体が小胞体シャペロンであるERp44によって捕獲され、糖タンパ ク質の運搬を担うERGIC-53上 でIgMの正確な会合体が形成されると考えられている。ERGIC-53は、小胞体とゴルジ体の中間区画であるERGICに局在する一回膜貫通タンパク質であり、糖鎖修飾 された様々な分泌タンパク質を小胞体からゴルジ体へと輸送させる役割を果たしている。全体構造は、糖鎖結合ドメイン (CRD)、ストークドメイン、膜貫通ヘ リックス(TM)およびERGIC局在モチーフで構成されており、ストークドメイン間で六量体を形成して機能すると考えられている。しかし、全長ERGIC-53の立体構 造は未決定であり、六量体としての分子機構は不明な点が残されている。またERp44との相互作用様式についても、十分には分かっていない。本研究は、全長 ERGIC-53の立体構造ならびにERp44やIgMとの複合体の構造解析によって、IgMの正確な会合体形成の分子基盤の解明を目指すものである。 今年度は、大量発現に成功した全長ERGIC-53について、精製条件の最適化とネガティブステインおよびクライオ電子顕微鏡によるサンプルのスクリーニング行った。またSEC-MALS/SAXS実験から、溶液状態の構造情報を得るに至り、カルシウムイオンに依存した構造変化が示唆される結果が得られた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

ネガティブステインおよびクライオ電子顕微鏡によるサンプルのスクリーニングを進めているが、良好な凍結グリッドの作成が達成できていない。

Strategy for Future Research Activity

凍結グリット作成条件のスクリーニングを引き続き継続して取り組み、ERGIC-53のクライオ電子顕微鏡での構造解析を目指す。また異なる条件下でのSEC-SAXS実験を行い、ERGIC-53の溶液構造変化について明らかにする。

  • Research Products

    (3 results)

All 2020 2019

All Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Presentation] Structural basis of zinc-dependent protein quality control in the early secretory pathway2019

    • Author(s)
      渡部 聡
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Cell Biology of Metals
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 亜鉛イオンとシャペロンタンパク質ERp44による新たなタンパク質品質管理機構2019

    • Author(s)
      渡部 聡, 天貝佑太, 山田桃, Roberto Sitia, 稲葉謙次
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Book] イメージング時代の構造生命科学2020

    • Author(s)
      天貝佑太, 渡部 聡、稲葉謙次
    • Total Pages
      248
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2021-01-27  

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