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2019 Fiscal Year Research-status Report

光化学系IIにおける塩素イオンの構造化学的な機能解明

Research Project

Project/Area Number 18K06158
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

梅名 泰史  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 特別契約職員(准教授) (10468267)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords蛋白質結晶構造解析 / 水分解反応の阻害因子 / 光合成蛋白質
Outline of Annual Research Achievements

光合成の水分解・酸素発生を担う光化学系II(PSII)蛋白質の活性に必須の塩素イオンの構造化学的な役割を明らかにするため、本研究では分子陰イオンに置換したPSIIの結晶構造解析を行い、置換による活性と構造の変化の相関の解析を行った。
これまでの研究の結果、分子陰イオンのアジ化物イオン、硝酸イオン、亜硝酸イオン及び酢酸イオンに、既存の塩素イオンを置換したPSII結晶化に成功した。それぞれの置換により活性が低下しており、置換による阻害作用を確認した。結晶構造解析の結果、それぞれ約2オングストローム分解能で解析することに成功した。それぞれの結晶構造から、分子イオンの存在を確認し、それぞれの分子陰イオンへの置換によるPSIIの構造変化を明らかにすることができた。その結果、塩素イオンと水素結合を撮っていたリジン残基が、分子陰イオンへの置換により大きく構造変化することで周辺の電荷配置が変わり、水分解の産物である水素イオンの排出が阻害されることが活性低下の要因であることがわかった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

4種類の分子陰イオンへ塩素イオンを置換することに成功し、それぞれの結晶構造を2オングストローム分解能で解析することができた。その構造から、活性低下の構造変化を見出すことに成功し、本来持っている塩素イオンの役割を明らかにすることができた。当初の研究目的をほぼ達成することができ、論文執筆の段階に入っているため。

Strategy for Future Research Activity

4つの分子陰イオンを複数の濃度で置換した結晶構造を得たため、濃度依存の構造と活性の変化について検討を行う。また、得られた結晶構造の解析を精密に行い、論文執筆のための準備を行う予定である。

Causes of Carryover

前年度の実験で使用予定の予算であったが、実験の進捗によって使用する試薬等の修正を行ったため、予算に差額が生じて次年度に繰り越すことになった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2019

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] An oxyl/oxo mechanism for oxygen-oxygen coupling in PSII revealed by an x-ray free-electron laser2019

    • Author(s)
      Suga M、Akita F、Yamashita K、Nakajima Y、Ueno G、Li H、Yamane T、Hirata K、Umena Y、Yonekura S、Yu L-J、Murakami H、Nomura T、Kimura T、Kubo M、Baba S、Kumasaka T、Tono K、Yabashi M、Isobe H、Yamaguchi K、Yamamoto M、Ago H、Shen J-R
    • Journal Title

      Science

      Volume: 366 Pages: 334~338

    • DOI

      10.1126/science.aax6998

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A versatile experimental system for tracking ultrafast chemical reactions with X-ray free-electron lasers2019

    • Author(s)
      Katayama Tetsuo、Nozawa Shunsuke、Umena Yasufumi、Lee SungHee、Togashi Tadashi、Owada Shigeki、Yabashi Makina
    • Journal Title

      Structural Dynamics

      Volume: 6 Pages: 054302~054302

    • DOI

      10.1063/1.5111795

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An alternative plant-like cyanobacterial ferredoxin with unprecedented structural and functional properties2019

    • Author(s)
      Motomura Taiki、Zuccarello Lidia、S?tif Pierre、Boussac Alain、Umena Yasufumi、Lemaire David、Tripathy Jatindra N.、Sugiura Miwa、Hienerwadel Rainer、Shen Jian-Ren、Berthomieu Catherine
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      Volume: 1860 Pages: 148084~148084

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2019.148084

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] β-Carotene Probes the Energy Transfer Pathway in the Photosystem II Core Complex2019

    • Author(s)
      Yoneda Yusuke、Nagasawa Yutaka、Umena Yasufumi、Miyasaka Hiroshi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 10 Pages: 3710~3714

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.9b01072

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 光合成で働く光化学系II複合体の結晶構造解析に基づく機能解明2019

    • Author(s)
      梅名泰史
    • Organizer
      2019年度日本生化学会九州支部例会
    • Invited
  • [Presentation] Crystallographic study on estimation of the valence of each of the four Mn atoms in Photosystem II using anomalous diffraction techniques2019

    • Author(s)
      Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Yoshiaki Kawano, Keitaro Yamashita, Hideo Ago, Masaki Yamamoto, Jian-Ren Shen
    • Organizer
      69th American Crystallography Association Annual meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Study of functional structures in photosystem II revealed by pH dependent structural changes2019

    • Author(s)
      Yasufumi Umena, Mayuho Adachi, Jian-Ren Shen
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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