Mismatch repair system in prokaryotes lacking canonical mutS-dependent system

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 18K06190
• Research Institution: National Center for Global Health and Medicine
• Principal Investigator: 竹本 訓彦 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, 上級研究員 (40546793)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 末次 正幸 立教大学, 理学部, 教授 (00363341) ; 福井 健二 大阪医科大学, 医学部, 助教 (00466038)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: ミスマッチ修復 / 突然変異 / DNA修復

Outline of Annual Research Achievements

これまでにEndoMSの発現をIPTG添加の有無により制御できるシステムを開発し、染色体上のendoMS遺伝子の位置と置き換えた株を作製していた。同株ではIPTG添加の有無によりEndoMSの発現量を制御でき、変異率が変化することを確認している。この株を用いて、IPTG誘導によるEndoMS発現の有無により、SOS response の対象遺伝子の発現変動が起こるかどうかを検討した。IPTG誘導によりEndoMSのmRNA量が上昇していることは確認できたものの、SOS responseの対象遺伝子の発現変動は検出されなかった。
2019年度にinsertion, deletionの変異が起こった変異体を選抜できる系（indel変異率測定系）を確立し、候補遺伝子(様々なnuclease)破壊株におけるindel変異率測定から insertion, deletion抑制に関わると考えられる遺伝子を同定していた。
2020年度からはこれらの解析から得られたindel変異抑制遺伝子の破壊株を対象に、Mutation accumulation-Whole genome sequencingによる、ゲノムワイドな変異率測定を試みている。現在、継代培養による変異蓄積を行っている。