2020 Fiscal Year Annual Research Report
In vivo function analysis of Sox-partner factor complexes in cell fate switch
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18K06267
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| Research Institution | Kochi University of Technology |
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Principal Investigator |
蒲池 雄介 高知工科大学, 環境理工学群, 教授 (90263334)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 転写因子 / Sox / ゲノム編集 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
胚発生過程における細胞の分化は、複数の転写因子がつくる複合体がスイッチ機能を果たすことによって進行している場合が知られている。Sox転写因子群は、このような機能を担う複合体を形成する中核因子の一つであり、胚発生の過程では様々な組み合わせのSox-パートナー因子複合体が、異なる分化状態の制御に重要な役割を果たしていると考えられる。しかし、in vivoにおける複合体の分子構成（組合せ）とそれらの標的配列・標的遺伝子、さらにそのような転写因子複合体がどのようなメカニズムで細胞分化スイッチとして機能するのかに関しては不明な点が多く残されている。
本研究では、SoxB1-パートナー因子複合体のin vivoでの解析を進めるため、まずゲノム編集を用いたノックインにより、内在のSox因子ならびにパートナー因子(Pax, POU因子)に異なるタグ配列を付加することことを実施した。このようなノックインラインを利用することで、特定の複合体をtag-ChIP（タグを利用したクロマチン免疫沈降）により高度に精製することが可能になる。これまでの研究で長鎖ssDNAをドナーにすることで効率的に複合タグ配列をゼブラフィッシュゲノムへノックインできること、さらに高い確率で生殖系列細胞でのノックインも起こることを見いだした。この手法を用いることでSoxならびにパートナー因子の遺伝子へのタグのノックインを迅速に進めることが可能になり、現在sox3、sox11a、pax6a遺伝子への複合タグ配列のノックインに成功している。
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Research Products
(4 results)
