2019 Fiscal Year Research-status Report
植物における新規転写型遺伝子サイレンシング機構の解析
| Project/Area Number |
18K06291
|
|---|
| Research Institution | Okayama University |
|---|
Principal Investigator |
池田 陽子 岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (80467688)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
|
| Keywords | 遺伝子サイレンシング / トランスポゾン / シロイヌナズナ |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
植物特異的なトランスポゾン関連ドメインPMDを持つMAIN及びMAIL1タンパク質は、シロイヌナズナにおいて転写型遺伝子サイレンシング（TGS）に寄与する。これまでの遺伝学的解析により、これらのタンパク質は既知の機構とは異なる機構でTGSに関わる事が示唆されているが、その分子機構は不明である。また、これらのタンパク質による転写型遺伝子サイレンシングは、維管束や分裂組織に特異的にみられるが、これまで組織特異的なTGSの制御機構は殆ど明らかになっていない。
これらの点にアプローチするため、2019年度は、2018年度に引き続き、MAIN及びMAIL1変異の遺伝学的サプレッサーのスクリーニングを継続して行なった。シロイヌナズナmail1変異体の複数のアレルに変異原処理を行った後代の植物集団の中から、mail1変異の表現型を抑圧する個体を選抜し、サプレッサー変異を持つと考えられる個体の解析を進めた。サプレッサー変異を持つ変異体の候補となる個体をシロイヌナズナの別のアクセッションの野生型と掛け合わせ、F２世代でのマッピングと変異同定のためのシーケンスの準備を進めた。
一方、MAIN及びMAIL1タンパク質が実際に核内でどのように機能しているかを明らかにするため、FAIRE-seqによりmain/mail1変異体における、クロマチンのアクセッシビリティの解析を行った。また、Chromosome conformation capture法（Hi-C）を用いた変異体の核内3次元構造の解析も進めている。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
育児休業による一時的な研究中断があったが、復帰後、研究の効率化、ペースアップを図り、遅れを取り戻しつつある。
|
| Strategy for Future Research Activity |
すでにスクリーニングにより複数得られているシロイヌナズナmail1変異体の遺伝学的サプレッサー候補個体の解析を進め、原因遺伝子の同定を試みる。また、PMDの相互作用因子の単離、核内での機能の解析等の生化学的解析を進め、PMDによるTGSの分子機構の解析を進めることで、ゲノム進化におけるトランスポゾンの活性化とその抑制機構を理解する事を目指す。
|
| Causes of Carryover |
2018年度後半及び2019年度前半産前産後休暇及び育児休業を取得したため、その間の研究が中断する形となり、計画していた研究費の一部を次年度使用することとなった。また、新型コロナウイルス問題により、2019年度末に予定していた出張が複数キャンセルとなったため、予定していた旅費を使用できなかった。
|
