• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

Roles of nucleolar factors in DNA methylation during leaf development

Research Project

Project/Area Number 18K06297
Research InstitutionChubu University

Principal Investigator

町田 千代子  中部大学, 応用生物学部, 特任教授 (70314060)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高橋 広夫  金沢大学, 薬学系, 准教授 (30454367) [Withdrawn]
町田 泰則  名古屋大学, 理学研究科, 名誉教授 (80175596)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords核小体 / 葉の発生分化 / エピジェネティック制御 / 核内ボディ / シロイヌナズナ
Outline of Annual Research Achievements

多細胞生物の形態形成においては、発生過程において特定の遺伝子を発現すると同時に、細胞特異的なエピジェネティックな抑制が重要である。我々は、シロイヌナズナのASYMMETRIC LEAVES1 (AS1)とAS2のタンパク質複合体が葉の向軸側分化の鍵因子であり、向軸側細胞分化過程では、背軸側遺伝子であるETT/ARF3の転写を直接抑制することにより表側分化を誘導する事を明らかにした。またAS2と核小体局在タンパク質が、ETT/ARF3遺伝子のDNAメチル化維持に関わる事、AS1-AS2と核小体タンパク質が協調的に作用することにより、より強く背軸側遺伝子を抑制することを明らかにしたが、その分子機構は未解明であった。また植物の発生分化における核小体の役割についてはほとんどわかっていない。そこで我々は第一に、核小体局在タンパク質 NUCLEOLIN1 (NUC1), RNAHELICASE10 (RH10)に加えて、HDA6遺伝子の変異体背景で、AS2 bodyの形状を解析した所、野生型と大きく変わらなかった。HDA6は核質に局在する事、HDA6遺伝子の変異体はas2変異体の向背軸形成不全の表現型を亢進しない事がわかっている。第二に、先進ゲノム支援の協力を得て、我々が開発したSIMON法(targeted BS-seq)(Vila-Pradel., 2019)を用いて、種々の変異体におけるDNAメチル化解析を行った。その結果、核小体に局在しないタンパク質をコードする遺伝子の変異体、hda6、eal等ではETT/ARF3遺伝子のDNAメチル化レベルにはほとんど変化がなかった。これまでの結果と合わせると、AS2 bodyは、核小体周縁部に局在してDNAメチル化等の場となっており、核小体は、その周縁部にエピジェネティックな発現抑制を維持する場を提供しているというモデルを支持する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Arabidopsis ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2): roles in plant morphogenesis, cell division, and pathogenesis2022

    • Author(s)
      Machida Yasunori、Suzuki Takanori、Sasabe Michiko、Iwakawa Hidekazu、Kojima Shoko、Machida Chiyoko
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 135 Pages: 3~14

    • DOI

      10.1007/s10265-021-01349-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ゲノムデータベースからシロイヌナズナ ASYMMETRIC LEAVES2(AS2)の起源を探る2022

    • Author(s)
      岩川秀和・小島晶子・笹部美知子・松本省吾・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会 茨城県つくば市(オンライン開催)
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるCRISPR/Cas9システムを用いた DNAメチル化編集技術の開発2022

    • Author(s)
      平田峻也・大河優奈・池田陽子・高橋広夫・西村泰介・町田千代子・小林括平・賀屋秀隆
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会 茨城県つくば市(オンライン開催)
  • [Presentation] Roles of ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2) and NUCLEOLIN1 in the Adaxial-Abaxial PolaritySpecification at the Perinucleolar Region in Arabidopsis.2021

    • Author(s)
      Ando S., Iwakawa H., Kojima S., Machida Y., Machida C.
    • Organizer
      The Mechanisms of Plant Development. FASEB SRC (USA) (WEB)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 葉の発生分化における核小体の役割の解明2021

    • Author(s)
      町田千代子・安藤沙友里・日比野哲紀・岩川秀和・笹部美知子・小島晶子・町田泰則
    • Organizer
      第38回日本植物バイオテクノロジー学会つくば大会(オンライン開催)
  • [Presentation] 葉の発生分化におけるDNAメチル化を介したエピジェネティック制御2021

    • Author(s)
      日比野哲紀・高橋広夫・岩川秀和・杉山宗隆・町田泰則・町田千代子・小島晶子
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会 東京都八王子市(オンライン開催)
  • [Presentation] シロイヌナズナのAS2のzinc-finger motifの分子機能の解析2021

    • Author(s)
      安藤沙友里・野元美佳・多田安臣・笹部美知子・山本興太朗・小島晶子・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会 東京都八王子市(オンライン開催)
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける脱メチル化酵素を用いたDNAメチル化編集技術の開発2021

    • Author(s)
      平田峻也・大河優奈・若林荘太朗・高橋広夫・町田千代子・池田陽子・西村泰介・小林括平・賀屋秀隆
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会 東京都八王子市(オンライン開催)
  • [Presentation] 植物の葉の発生分化に関わるAS2 body形成における核小体の役割の解明2021

    • Author(s)
      町田千代子・安藤沙友里・日比野哲紀・岩川秀和・栗原大輔・東山哲也・笹部美知子・小島晶子・町田泰則
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会 神奈川県横浜市
  • [Presentation] ゲノムデータベースを利用した植物に特有のAS2/LOBファミリーの分子系統解析2021

    • Author(s)
      岩川秀和・小島晶子・松本省吾・町田泰則・町田千代子
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会 神奈川県横浜市

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi