Addressing a model of mycobacterium evolution via sexual reproduction: approaches by molecular genetics and population genomics

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K06357
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45020:Evolutionary biology-related
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: Yano Hirokazu 東北大学, 生命科学研究科, 講師 (20646773)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 抗酸菌 / プラスミド

Outline of Final Research Achievements

We revealed population structure of M.avium subsp.hominisuiss (MAH) using publicly available genomic data, then detected exchanges of chromosomal fragments between two lineages one carrying many recombination footprints and the other carrying little. We found a recombination-cold region on the MAH chromosome, wherein the polymorphism can be used as lineage markers for genotyping. We released complete genome sequences of 5 MAH strains after polishing sequences. We obtained evidence that MAH carry plasmids.

Free Research Field

遺伝学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

抗酸菌の一種Mycobacterium avium (MAC菌) は難治性の肺MAC症の原因菌である。日本で社会問題となっているM.aviumが組換えを行う菌種であることはゲノム情報から推察されているものの、実験による再現が報告されていない。本研究は日本の M.aviumがどのような条件で何の遺伝子を交換しているのか解明することを見据え、それを実現するための実験系構築とデータセット構築を目指したものである。得られる情報は今後のM.aviumを用いた分子遺伝学実験や細菌GWAS研究に有用な知見を提供すると期待される。