2022 Fiscal Year Research-status Report
ダニ類最後のエニグマ（謎）：ニセササラダニ類の進化的変遷
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18K06392
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| Research Institution | Hosei University |
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Principal Investigator |
島野 智之 法政大学, 自然科学センター, 教授 (70355337)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
蛭田 眞平 独立行政法人国立科学博物館, 分子生物多様性研究資料センター, 特定非常勤研究員 (80624642)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 系統分類学 / ダニ学 / 動物分類学 / 汎ケダニ目 / 汎ササラダニ目 / 胸板ダニ上目 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
昨年に引き続き，胸板ダニ類の系統推定において，核遺伝子では18S rRNAや28S rRNA(主にD3領域)，EF1-alpha，HSP82が，ミトコンドリア遺伝子ではCOIが主に用いられている.今年度行ったショットガンシーケンスでは，最小5ngの抽出DNAよりほぼすべての上述のマーカーを含む塩基配列決定が可能であった.個体が小さいためDNA およびRNA量の確保が難しい分類群であるダニ類において，エタノール固定された1個体からでも系統推定に十分な配列を確保する方法を運用している．
超並列シークエンサーから出力される配列データは以下の流れでの配列決定方法を確立した.出力ファイル(fastq)をfastpでのフィルター処理の後，GetOrganelleでのアセンブリを行う.続いて，Ugeneでのde noveアセンブリを行い，その結果をBandageに読み込ませ，各種遺伝子配列捜索を行い.さらにCLC Genomics Work Benchでのde novoアセンブリとmap readによる確定を行っている．
これらに基づいた，分岐年代推定の方法を確立した．現在，それぞれの分類群の分岐年代の推定に，取り組んでいる．また，ミトコンドリアの遺伝子配列についても，考察をすすめている．
また，ヤワスジダニ科のカタツムリダニの2新亜種について記載を行った(Waki et al., 2022)．日本産のトキについていたウモウダニ2種の再記載（Waki and Shimano, 2022），コアホウドリから得られた2種のウモウダニの再記載と記録をおこなった（Waki et al., 2022）．市民科学と生物種の保全のためSNSを媒体としたササラダニの新種記載を行った（Pfingstl et al, 2022）．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
材料となるダニのショットガン・シークエンスまで終えることができた．以前，失気門団というひとつの分類群であったが，形態情報によって2つの亜目とすることが提案されたクシゲマメダニ亜目とニセササラダニ亜目であるが，18S rDNAから得られた系統樹では，ニセササラダニ亜目は汎ササラダニ亜目内でクレードをつくったため，2亜目の体系は18S rDNAにもとづいた系統樹からは支持された.本結果は，可能な限り早く論文としてまとめたい．
ショットガンシークエンシングにより核および，ミトコンドリア上の複数の遺伝子座のシークエンス結果は全体的にそろった.しかし，ショットガン・シークエンシングの結果は下等ササラダニ類に共通したミトコンドリア遺伝子の異常形態が得られたので，今後サンガーシークエンスによって，これを確認する必要がある．潮間帯ササラダニ類については，全球的なサンプリングから，ミトコンドリアゲノムに基づいた，次の研究の大きなテーマとなるような，進化戦略への新たな知見もえられた．
なお，現在，投稿中であるダニの高次分類についての高次分類の提案が，投稿先の学会誌のトラブルによって，査読が進まず，別の雑誌に再投稿した.
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| Strategy for Future Research Activity |
現在，査読中のダニ類の新体系の提案については，早々に出版にまで至らせたい．
引き続き解析中のミトコンドリアゲノムについては，MITOS2を用いて，アノテーションの付与を行っている.一部tRNAは発見できなかったので，ARAGORNによって検索し，これでも見つからない場合は，アンチコドン配列を手動で捜索し，RNAFoldによる2次構造推定を頼りに遺伝子領域決定を行っている．下等ササラダニ類に共通したミトコンドリア遺伝子の異常形態が得られたので，今後サンガーシークエンスによって，引き続き，これを確認する必要がある．以上のことにより，ニセササラダニ類の分類学的位置を検証するとともに，胸板ダニ上目全体の高次体系について総合的に議論し，必要に応じて次の新しいダニ類の体系を提案する
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルスの流行によって，打合せの機会が減り解析などが遅れているため. 遺伝子配列の解析を早めに行い解析をすすめる.また，新型コロナウイルスの流行によって，学会発表などの旅費が減少した.しかしながら，学会発表は減少したものの，この分の論文発表などを増加させるこ とができた.また，旅費が節約できた分，次年度の遺伝子解析にこれを使用し，さらに解析の精度をあげて，最終年度の成果発表に望みたい.
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