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2019 Fiscal Year Research-status Report

抗がん剤標的酵素の精密構造解析

Research Project

Project/Area Number 18K06600
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中村 照也  熊本大学, 大学院先導機構, 准教授 (40433015)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords構造生物学 / 中性子結晶構造解析 / X線結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

ヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素は,細胞内の酸化ヌクレオチドを加水分解することで突然変異を抑制する一方で,がん細胞に高発現することで,がん細胞の生存にも寄与することが新たに報告されて以来,新規作用機構の抗がん剤ターゲットとして注目されている.本研究は,本酵素のX線・中性子を連携させた精密構造解析を行い,水素原子レベルでの酵素反応機構を明らかにすると同時に新たな阻害剤探索のための活性部位の詳細な構造情報も得ることを目的としている.
昨年度までの研究成果であるヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素の構造学的基盤から,これまでに報告されていない新たなヌクレオチド(新規ヌクレオチド)が基質となりうる可能性が示唆されたため,新規ヌクレオチドの複合体結晶を調製し,放射光施設Photon Factory Advanced RingのビームラインNE3Aにて1.0オングストローム分解能のX線回折強度データを収集した.構造解析を行った結果,新規ヌクレオチドの加水分解部位がこれまでの基質と同様の様式で活性部位に結合していることが分かった.さらに,結晶内反応を行った結晶を用いた構造解析も行うことで,新規ヌクレオチドが生成物へと加水分解されることを確認した.これらの実験に加え,新規ヌクレオチドの加水分解活性測定,活性阻害効果の検証,さらには結合親和性解析を行うことで,本新規ヌクレオチドはヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素に対して結合親和性が非常に高い基質であることを明らかにした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年の中性子・X線の回折強度データ収集に続き,新規基質の同定,構造解析を行うことができたため,研究はおおむね順調に進展している.

Strategy for Future Research Activity

他の種類の基質複合体についても大型結晶を調製し,中性子・X線の回折強度データを収集,構造解析を進める.

Causes of Carryover

実験プロトコールの改良に伴い,予定よりも試薬使用量を少し削減することができたため.

  • Research Products

    (3 results)

All 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Structural analysis of TIFA: Insight into TIFA-dependent signal transduction in innate immunity2020

    • Author(s)
      Nakamura Teruya、Hashikawa Chie、Okabe Kohtaro、Yokote Yuya、Chirifu Mami、Toma-Fukai Sachiko、Nakamura Narushi、Matsuo Mihoko、Kamikariya Miho、Okamoto Yoshinari、Gohda Jin、Akiyama Taishin、Semba Kentaro、Ikemizu Shinji、Otsuka Masami、Inoue Jun-ichiro、Yamagata Yuriko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 5152

    • DOI

      10.1038/s41598-020-61972-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 酵素の精密構造解析 抗がん剤標的分子の基質認識における水素原子の役割2019

    • Author(s)
      中村 照也
    • Organizer
      日本プロテオーム学会 2019年大会・第70回日本電気泳動学会
    • Invited
  • [Presentation] ヒト酸化ヌクレオチド加水分解酵素の新規基質の同定2019

    • Author(s)
      藤宮 佳菜、中村 照也、平田 啓介、池鯉鮒 麻美、池水 信二、山縣 ゆり子
    • Organizer
      第43回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム

URL: 

Published: 2021-01-27  

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