2020 Fiscal Year Research-status Report
日本人における薬物性肝障害のゲノムバイオマーカー探索、関連機能解析と診断系構築
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18K06775
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| Research Institution | National Institute of Health Sciences |
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Principal Investigator |
斎藤 嘉朗 国立医薬品食品衛生研究所, 医薬安全科学部, 部長 (50215571)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
荒川 憲昭 国立医薬品食品衛生研究所, 医薬安全科学部, 主任研究官 (60398394)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | ゲノム / 薬物性肝障害 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
薬物性肝障害に関し、主に5箇所の拠点病院より、発症患者の血液および臨床情報を収集した。令和2年4月～令和3年2月で、18例を収集した。ゲノムDNAを用いたHLA解析は、PCR-SSO法により行った。またゲノム網羅的遺伝子多型解析は、イルミナ社Human Omni2.5-8ビーズチップ（ゲノム広域に分布する一塩基多型を中心とした約250万遺伝子多型のタイピングチップ）を用いて行った。対照としては、日本ファーマコゲノミクス・データサイエンスコンソーシアムから譲渡を受けた約2,800人の日本人健康成人におけるHLA及び遺伝子多型の頻度情報を用いた。発症群と対照群におけるHLA型や遺伝子多型頻度を比較するケース・コントロール研究を行い、Fisherの正確確率検定等を用いて統計解析を行った。多重性補正は、Bonferroni法により行った。これまでに発症患者のゲノム試料と臨床情報の収集を終了した。さらにゲノム解析も概ね終了し、健康成人試料の結果を対照に関連解析を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
これまでに収集した総収集検体数は、332例となった。なお、一部の例外を除き、日本肝臓学会のDDWJ-2004ワークショップで制定された薬物性肝障害のスコアリングに基づき、専門医が総スコア5点以上を付けた「可能性有り」または「可能性が高い」症例を収集した。被疑薬は多岐に及んでおり、最も症例数の多いアセトアミノフェン（現在31例）、ロキソプロフェン（現在22例）、スタチン（現在16例）はある程度の症例数が集積されつつある。病型別の解析では、肝細胞障害型が207例となった。ゲノム解析は一部を除き順調である。またImputation用のソフトを導入し、イルミナ社Human Omni2.5-8ビーズチップにおいてVersionが異なる場合でも、関連解析が可能となるようにした。HLA及び遺伝子多型の関連解析は順調に進んでいる。
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| Strategy for Future Research Activity |
ゲノム試料の収集については予定に達したため終了した。HLA及びゲノム網羅的関連解析に関し、論文執筆等の取りまとめを予定している。
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルス感染症の蔓延に伴う業務の急増により、ゲノム解析の一部が大幅に遅延したため。
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