2021 Fiscal Year Annual Research Report
A large-scale analysis of behavioral phenotype in genetically engineered mice
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18K07400
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| Research Institution | Fujita Health University |
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Principal Investigator |
服部 聡子 (高井聡子) 藤田医科大学, 総合医科学研究所, 助教 (00415564)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 網羅的行動解析 / 大規模データ / データベース / 遺伝子改変マウス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、研究活動においても、デジタルトランスフォーメーションの必要性が高まっており、研究データを戦略的に共有するためのプラットフォームの構築が求められている。また、大規模データの取得や解析のみならず、それらを二次利用したデータ駆動型研究の推進も盛んになってきている。
本研究では、こうした流れを受け、これまでに申請者の所属研究室で取得してきた220系統以上の遺伝子改変マウスとその統制群マウス、あわせて数千匹から取得した大規模な網羅的行動解析データを整備し、データベースにて公開することを目指している。本研究にて整備しているデータは、感覚・知覚、運動だけでなく、情動や記憶学習など高次機能解析を含む20種類以上のテストから200個以上の行動指標取得している他、ほぼ同一の設備、環境、プロトコルでデータを取得していること等、世界的にも類を見ないものであり、その利用価値は高いと考えられる。
本年度は、引き続きデータベースに蓄積する網羅的行動解析データの取得を行うとともに、二次利用をしやすいよう、データベースを刷新した。また、グラフ表示、検索機能、データのダウンロード機能等、利便性の高いプラットフォームの作成を行った。さらには、こうしたプラットフォームを活用し、これまでに取得した行動解析データの類似性から、データ駆動型に系統を分類する方式について開発を進めた。最終年度となった本年度は、これらの改良・開発結果をまとめ、日本神経科学大会のシンポジウムにて発表を行った。
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