2018 Fiscal Year Research-status Report
老化関連長鎖ncRNAとp53転写複合体による細胞老化の制御機構の解析
Project/Area Number |
18K07439
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
橋本 直子 千葉大学, 大学院医学研究院, 特任助教 (10724875)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 知明 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (50447299)
高野 博之 千葉大学, 大学院薬学研究院, 教授 (60334190)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | 細胞老化 / ncRNA / エピゲノム / 動脈硬化 |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では細胞老化誘導のエピゲノム制御機構の解明を目的として、p53クロマチン複合体解析と細胞老化関連lncRNAの同定、機能解析を通して、転写因子-lncRNA複合体の視点から細胞老化の分子メカニズムに迫ることを目的としている。 p53を中心とした細胞老化のシグナルに着目し、(A) LC-MS/MSを用いたp53クロマチン複合体のエピゲノム制御因子の生化学的な探索、(B) 次世代シーケンサーを用いたRNA-seqとChIP-seqの連結解析による細胞老化特異的lncRNAの探索、さらに(C) RIP(RNA immunoprecipitation)-seqを組み合わせて、p53転写因子-RNA複合体解析を行って新規のlncRNA候補を絞り込み、(D) p53クロマチン複合体のエピゲノム制御候補分子及び細胞老化関連lncRNAの細胞老化形質獲得における機能解析を行う予定である。 今年度は、ヒト線維芽細胞株を用いて、老化細胞のRNA-seq解析で高発現のlncRNA候補配列を同定した。またヒストンコードの特異抗体(AcH3, H3K4me 3, H3K9me3, H3K27me3)で免疫沈降して、ChIP-seqでヒストンコードのプロファイルの網羅的解析を行い、細胞老化特異的lncRNA候補を同定するという成果を得た。 この成果を元に、細胞老化誘導におけるp53の翻訳後修飾および、RNA免疫沈降を用いたp53や老化調節クロマチン会合分子に巻き付いているRNAの網羅的の解析に進む予定である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
今年度は、RNA-seq、ChIP-seqの解析を重点的に進め、老化関連長鎖ncRNA候補の同定という成果を得ることができたため。
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Strategy for Future Research Activity |
今後は、タンパク複合体の生化学的解析を行う予定である。また、RNA免疫沈降により、p53や老化調節クロマチン会合分子に巻き付いているRNAをゲノムワイドに高速シークエンサーで解析する。そして、今年度得られた老化関連長鎖ncRNAの候補配列の中から、転写因子複合体となって機能するlncRNAを抽出して、細胞老化関連lncRNA候補20個に絞り込み、当該研究の目的である細胞老化誘導のエピゲノム制御機構の解明を進めていく予定である。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Glucagonoma with necrolytic migratory erythema: metabolic profile and detection of biallelic inactivation of DAXX gene.2018
Author(s)
Tamura A, Ogasawara T, Fujii Y, Kaneko H, Nakayama A, Higuchi S, Hashimoto N, Miyabayashi Y, Fujimoto M, Komai E, Kono T, Sakuma I, Nagano H, Suzuki S, Koide H, Yokote K, Iseki K, Oguma R, Matsue H, Nojima H, Sugiura K, Yoshitomi H, Ohtsuka M, Rahmutulla B, Kaneda A, Inoshita N, Ogawa S, Tanaka T.
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Journal Title
J Clin Endocrinol Metab.
Volume: 103
Pages: 2417-2423
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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