2021 Fiscal Year Annual Research Report
Cell-type specific expression analysis in postmortem brains of patients with schizophrenia
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18K07567
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
文東 美紀 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 准教授 (00597221)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | ヒト死後脳 / 細胞種 / 発現解析 / 統合失調症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、統合失調症患者の脳組織において、どの細胞種でどのような遺伝子発現変化が生じているかを明らかにすることを通じて、精神疾患の分子病態の理解を進め、将来の創薬の起点を得ることである。そのために患者・健常者の死後脳前頭葉からさまざまな細胞種由来の細胞核を分画したのち、RNA-seqによる網羅的な遺伝子発現解析を行い、患者-健常者間で発現差異が見られる遺伝子を検出することにより、病態・病因に関与する分子やパスウェイを同定することを目指している。
本年度は、統合失調症患者と健常者の死後脳（n=10ずつ）から、セルソーターで神経細胞・オリゴデンドロサイト・アストロサイト・活性型マイクログリアの細胞種由来の核を100個ずつ分画し、微量RNAからの発現解析に適したRamDA-seq法でライブラリの作成を行い、イルミナ社Nova-seqでシーケンスデータの取得・バイオインフォマティクス解析を行った。それぞれのライブラリからは、おおむね良好なシーケンスデータが取得できていた。tSNE解析では、細胞種特異的な発現変動が観察された。また活性型マイクログリア画分では、患者-健常者間において、シナプスに関連する遺伝子の発現変動が検出され、統合失調症の病因に寄与する可能性が考えられた。
ただし今回の実験データでは、ライブラリ作成日によるバッチ間差が検出されており、現在これを補正するためのインフォマティクス解析について、検討を行っている。補正条件が決定された後に、さらなる解析を行っていく予定である。
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