2018 Fiscal Year Research-status Report
片側発症一卵性双生児の網羅的ゲノム解析による胆道閉鎖症の遺伝的素因の解明
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18K07844
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
別所 一彦 大阪大学, 医学系研究科, 講師 (80423169)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 胆道閉鎖症 / 双胎 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
大阪大学のヒトゲノム研究審査を申請し、2018年12月に承認され予定していた３組の一卵性双生児とその保護者に研究内容を説明し同意を得た。同意を得た後に、それぞれの双胎から血液を採取し、PSS社のMagDEA Dx SVを使用してDNAを抽出し、大阪大学微生物病研究所に提出した。１組の解析結果は大阪大学微生物病研究所からすでに却ってきたため、胆道閉鎖症の発生に関与する遺伝子の有無について絞り込みをすすめている。残り2組の検体の解析結果を待機中である
また、ホルマリン固定胆管組織中の胆管上皮細胞からDNAを抽出するための予備実験として、QIAGEN社のGene Read DNA FFPE Kitを使用して条件検討を行っている。
さらに乾燥ろ紙血からのDNA抽出の予備実験として、QIAGEN社のDNA Micro Kitを使用して条件検討を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
患者家族からの同意取得、双胎からの血液検体の採取・配列解析提出は当初の実験計画通りに進行している。
肝門部空腸術時の摘出胆道組織も回収できているが、組織中の胆管上皮細胞より特異的に抽出した遺伝子の配列を解析することにしたため、エクソーム解析に耐える質と量のゲノム遺伝子を採取する条件について検討中である。また乾燥濾紙血よりの良質な核酸の抽出法に関しても同時に検討している。
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| Strategy for Future Research Activity |
すでに提出済みの血液検体に関しては、結果が揃い次第、双胎間のゲノム配列の相違を解析する。また胆管上皮細胞、乾燥濾紙血より高品質・必要容量のゲノムDNAが抽出できつつあり、条件検討が済み次第、患者検体を用いた解析を行う。
また他施設で診療している一卵性双生児の胆道閉鎖症患者の特定を進めており、特定でき次第、多施設共同研究として、患者及び患者家族から同意を取得し、検体の採取・解析を開始する。
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| Causes of Carryover |
対象外来患者の血液検体を全エクソーム解析に提出済みだが、一部支払い請求は2019年度に行われる予定である。また胆管上皮細胞及び乾燥濾紙血より採取したDNAの解析に関しては、DNAの抽出条件を検討中であり、実際に得られている検体の解析は今年度以降行う予定にしている。
実験法、解析法について海外の施設との打ち合わせを計画していたが、検討会は2019年度以降に行うこととなったため旅費の申請も今後行う予定である。
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[Journal Article] Total bile acid concentration in duodenal fluid is a useful preoperative screening marker to rule out biliary atresia.2018
Author(s)
Fukuoka T, Bessho K, Tachibana M, Satomura Y, Konishi A, Yasuda K, Kimura T, Hasegawa Y, Ueno T, Miyoshi Y, Ozono K
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Journal Title
Journal of pediatric gastroenterology and nutrition
Volume: 67
Pages: 383-387
DOI
Peer Reviewed
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