2020 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular classification of biliary cancer by transcriptome analysis of FFPE specimens
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18K07956
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
新井 康仁 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 主任研究員 (80222727)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 胆道がん / トランスクリプトーム解析 / 分子診断 / 分子標的 / FGFR2 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、バイオプシーや外科手術において診療時に採取された腫瘍ホルマリン固定(FFPE)標本の残余を用いてRNAシークエンス解析を行なって臨床病理学的、分子生物学的特徴を明らかにし、胆道がんの個別化診断を開発して分子標的や免疫療法のアンブレラ型臨床試験開発に結びつけることが目標である。針生検や外科手術からの215症例のFFPE標本からtotal RNAの抽出を行い、199症例 (92.6%)ついては、FGFR1,FGFR2, FGFR3, FGFR4, KRAS, IDH1を含む1,385のがん関連遺伝子のcDNAキャプチャー法によるターゲットRNAシークエンスを進めた。この結果、19症例にFGFR2融合遺伝子を同定した。FGFR2は15種類の幅広いパートナー遺伝子と融合遺伝子を形成していたが、BICC1遺伝子が最も頻度が高かった(4/19)。一部の検体はFGFR1, FGFR2, FGFR3遺伝子プローブを用いたAnchored multiplex PCR法 (AMP-PCR) による同定も行い、FGFR2融合遺伝子の検出結果がcDNAキャプチャー法と一致することを確認した。
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[Journal Article] Molecular detection and clinicopathological characteristics of advanced/recurrent biliary tract carcinomas harboring the FGFR2 rearrangements: a prospective observational study (PRELUDE Study)2021
Author(s)
Maruki Y, Morizane C, Arai Y, Ikeda M, Ueno M, Ioka T, Naganuma A, FurukawaM, Mizuno N, Uwagawa T, Takahara N, Kanai M, Asagi A, Shimizu S, Miyamoto A, Yukisawa S, Kadokura M, Kojima Y, Furuse J, Eguchi-Nakajima T, Sudo K, Kobayashi N, Hama N, Yamanaka T, Shibata T and Okusaka T.
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Journal Title
Journal of Gastroenterology
Volume: 56
Pages: 250
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] E74-Like Factor 3 Is a Key Regulator of Epithelial Integrity and Immune Response Genes in Biliary Tract Cancer2021
Author(s)
Suzuki M, Saito-Adachi M, Arai Y, Fujiwara Y, Takai E, Shibata S, Seki M, Rokutan H, Maeda D, Horie M, Suzuki Y, Shibata T, Kiyono T and Yachida S.
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Journal Title
Cancer Research
Volume: 81
Pages: 489
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The potential application of PD-1 blockade therapy for early-stage biliary tract cancer.2020
Author(s)
Umemoto K, Togashi Y, Arai Y, Nakamura H, Takahashi S, Tanegashima T, Kato M, Nishikawa T, Sugiyama D, Kojima M, Gotohda N, Kuwata T, Ikeda M, Shibata T, Nishikawa H.
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Journal Title
International Immunology
Volume: 32
Pages: 273
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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