2020 Fiscal Year Annual Research Report
Genomic and epidenomic analysis of bacteria causing Buruli ulcer
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18K08312
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
星野 仁彦 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 室長 (20569694)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
深野 華子 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 研究員 (40807541)
酒井 香奈江 神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 特命助教 (60599447)
吉田 光範 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 主任研究官 (70772630)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | ゲノムメチル化 / 病原性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
2018年までに10株以上のブルーリ潰瘍原因菌菌株について、次世代シークエンサー(NGS)を用いて全ゲノム核酸解析を行ってきた。この過程で日本におけるブルーリ潰瘍原因菌は全て、亜種であるM. ulcerans subsp. shinshuenseであることを見出した。また分離菌は驚くべきことに地域差があり、分離地域ごとに類似した菌種が固まっていることを見出した。これらの結果を受けて、2019年度は、ブルーリ潰瘍原因菌8株のメチル化について、NGSを用いて解析を行った。驚くべきことに、アフリカ株とアジア株で全ゲノム領域において、メチル化の程度が異なることが示唆された。我々はアフリカ株とアジア株を背景を統一したマウスへの感染実験を行っているが、Average Nucleotide Identity (ANI)は両群で98%以上であるにもかかわらず、病原性（感染開始から個体死亡までの期間）が異なることを示しているが、この原因の一つにメチル化の程度が関与している可能性を考え、2020年度はより多くの菌株のメチル化をNGSで解析を行なったところ、アフリカ株集団とアジア株集団での相違が明確化されたので、この成果を論文としてまとめて発表する予定とした。
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[Journal Article] A Case Report of Bursitis,Bacteremia,and Disseminated Infection of Mycobacteroides(Mycobacterium)abscessus subsp.massiliense.2021
Author(s)
Oka K,Morioka H,Asakura T,Sato Y,Tetsuka N,Iguchi M,Kanematsu T,Fukano H,Hoshino Y,Kiyoi H,Yagi T.
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Journal Title
Internal medicine
Volume: 20
Pages: 6189-20
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Nutritional status positively impacts humoral immunity against its Mycobacterium tuberculosis, disease progression, and vaccine development.2020
Author(s)
Mamiko Niki, Takashi Yoshiyama, Hideaki Nagai, Yuji Miyamoto, Makoto Niki, Ken-Ichi Oinuma, Taishi Tsubouchi, Yukihiro Kaneko, Sohkichi Matsumoto, Yuka Sasaki, Yoshihiko Hoshino
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Journal Title
PloS one
Volume: 15
Pages: e0237062
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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