2019 Fiscal Year Research-status Report
造血システムの加齢に伴うエピゲノム変化と造血器腫瘍発症の分子基盤
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18K08348
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
大島 基彦 東京大学, 医科学研究所, 助教 (70506287)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 加齢変化 / 造血幹細胞 / ATAC-seq / RNA-seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
造血幹前駆細胞の加齢に伴うオープンクロマチン領域の変化と遺伝子発現変動について検証を行うため、 若齢および老齢マウスのHSC, MPP-4, GMP, CLP, MEP 分画を用いてATAC-seq、およびRNA-seq を行なった。主成分分析やクラスタリングを行なった結果、クロマチン領域と遺伝子発現は全体として似たような加齢変化の傾向を示した。また各分画における、加齢に伴うDifferentially accessible regions(DARs) を用いてモチーフ解析を行ったところ、各分画に固有の転写因子結合モチーフの変動が見られることが明らかになった。転写因子結合モチーフの変動領域に紐づけられた遺伝子群について、遺伝子発現データとの比較を行なった結果、DARsに関連した遺伝子発現の変動についても確認された。今後、single cell ATAC-seqを行うことで更に詳細な検証を行うとともに、DARsに関連する造血関連転写因子の発現変動や機能変動についての検証や、標的遺伝子の加齢に関連した生理的な変化や加齢関連造血器疾患との関わりについて詳細に検討する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
加齢に伴う造血幹前駆細胞の変化について、過去の研究結果を裏付ける結果が得られると共に、造血分化における各分化段階に固有のクロマチン変動領域の変化を中心とした分子機構に関わる興味深い知見が蓄積しており、一部計画と異なるところはあるが、発展させていく中で当初の疑問を明らかにし、更に新たな知見が得られる事が予想される。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の計画を推進するとともに、ATAC-seq によりこれまでに報告のない様々な変化についての情報が得られており、今後はsingle cell ATAC-seq を行うことで更に詳細な解析を行うと共に、変動に関わる造血関連転写因子と標的遺伝子の生理的な加齢関連変化や造血器における加齢関連疾患との関わりについて解析していく事で、加齢に伴う造血幹細胞の変化についての包括的な理解が得られるよう研究を進めていく。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Akt inhibition synergizes with polycomb repressive complex 2 inhibition in the treatment of multiple myeloma.2019
Author(s)
Rizk M, Rizq O, Oshima M, Nakajima-Takagi Y, Koide S, Saraya A, Isshiki Y, Chiba T, Yamazaki S, Ma A, Jin J, Iwama A, Mimura N.
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 110
Pages: 3695-3707
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] KDM2B in polycomb repressive complex 1.1 functions as a tumor suppressor in the initiation of T-cell leukemogenesis.2019
Author(s)
Isshiki Y, Nakajima-Takagi Y, Oshima M, Aoyama K, Rizk M, Kurosawa S, Saraya A, Kondo T, Sakaida E, Nakaseko C, Yokote K, Koseki H, Iwama A.
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Journal Title
Blood Adv
Volume: 3
Pages: 2537-2549
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] The chromatin-binding protein Phf6 restricts the self-renewal of hematopoietic stem cells.2019
Author(s)
Miyagi S, Sroczynska P, Kato Y, Nakajima-Takagi Y, Oshima M, Rizq O, Takayama N, Saraya A, Mizuno S, Sugiyama F, Takahashi S, Matsuzaki Y, Christensen J, Helin K, Iwama A.
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Journal Title
Blood
Volume: 133
Pages: 2495-2506
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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