2018 Fiscal Year Research-status Report
ヒト病原性クローン・耐性因子を介したヒト－環境における薬剤耐性菌循環の俯瞰的解析
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18K08428
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| Research Institution | Shinshu University |
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Principal Investigator |
長野 則之 信州大学, 学術研究院保健学系, 教授 (00747371)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 小児 / 下水流入水 / 愛玩動物 / blaCTX-M-27 / B2-O25b-ST131-H30R / MRSA / mcr-1 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ヒトと環境の間での薬剤耐性菌及び耐性遺伝子の循環、これらを担う環境リザーバーの重要性の解明を主要な目的とした。
本年度は、小児専門病院の臨床材料由来ESBL産生Escherichia coliを解析し、blaCTX-M-27保有の推定多剤耐性・高病原性世界流行クローンB2-O25b-ST131-H30R/non-Rxが優位に検出され、国内の成人における疫学知見と一致していた。小児感染症治療の使用可能抗菌薬が限定されており、薬剤耐性菌の出現・動向の監視が重要である。
愛玩動物由来MRSA56株の分子学的解析を実施し、我々の既報のヒト臨床由来MRSA178株との系統ネットワーク解析を行った。CA-MRSAの遺伝系統はヒトと愛玩動物の両方に適応性を有し、愛玩動物がCA-MRSAの感染源や媒体となる可能性が示唆される。HA-MRSAにはヒトのみに適応性を有する遺伝系統に加え、ヒトと愛玩動物の両方に感染し得る遺伝系統が存在する可能性が考えられた。
環境水として下水処理場4施設から収集した流入水由来ESBL産生E. coliの解析で、blaCTX-M保有73株は31と多様なSTに分別されたが、blaCTX-M-27保有B2-O25b-ST131-H30R/non-Rxをはじめヒト臨床的に重要なblaCTX-M保有クローンが複数の流入口、複数の処理場で検出された。さらに国内起源の臨床由来株で報告のないキメラ遺伝子blaCTX-M-64並びにblaCTX-M-123も確認され、未処理下水のESBL遺伝子変異、組み換えの進化的hotspotとしての重要な役割が示唆される。多剤耐性菌重篤感染症の最後の砦的治療薬コリスチンの耐性株については国内のヒトでの報告は極めて稀であるが、流入水からプラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli7株が検出され、現在NGSにて解析中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度に下水流入水由来ESBL産生E. coli株並びに保有blaCTX-M遺伝子の分子遺伝学的解析が終了し、論文化の段階であること。また、下水流入水由来プラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli並びにmcr-1を担うプラスミドについての全ゲノム配列解析、プラスミド全塩基配列解析が終了していること。
愛玩動物由来MRSAの解析知見についての論文が投稿中であること。
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| Strategy for Future Research Activity |
下水流入水由来プラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1保有E. coli並びにmcr-1を担うプラスミドについての全ゲノム配列解析、プラスミド全塩基配列解析知見の論文作成に着手する。さらにはプラスミド性コリスチン耐性遺伝子mcr-1とは異なるコリスチン耐性機構である染色体上の二成分制御系因子pmrA、pmrB、mgrBなどの遺伝子変異/IS挿入などを保有するKlebsiella spp. 株の全ゲノム配列解析が進行中である。ヒト難治性感染症の起因菌であるAcinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosaについてこれまでに実態が把握されていない愛玩動物由来株の収集、薬剤耐性菌の疫学解析に着手する。病院環境 (病棟シンク)より検出されたNDM-1産生Acinetobacter pittiiについてWGS解析を行い、論文化の予定である。
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| Causes of Carryover |
（理由）
ゲノム配列解析において、重要株を先行して解析し、その結果に基づき後の解析を行うことが妥当と考えられたため。
（使用計画）
次年度請求額と合わせて、解析対象株を選択し、ゲノム解析やプラスミドの全塩基配列解析を実施する。さらには塩基配列の隙間（ギャップ）を埋めるためのPCRシークエンシングによるプラスミド配列取得を行うのに使用することを計画している。
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Research Products
(15 results)
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[Presentation] 洗浄用シンクより検出されたNDM-1 産生Acinetobacter pittii の解析：bla NDMのreservoir としての病棟内環境の危険性2019
Author(s)
春日恵理子1, 名取達矢1, 林航2, 長野由紀子3, 長野則之2, 堀内一樹1, 根岸達哉1, 松岡美奈1, 樋口祥子1, 松本剛1, 本田孝行1
Organizer
第30回日本臨床微生物学会総会・学術集会
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[Presentation] 国内の種々材料由来腸内細菌科細菌におけるコリスチン耐性機序の多様性.2018
Author(s)
林航, 田中隼斗, 谷口唯, 小出将太, 松尾奈緒, 小出将太, 長野由紀子, 前山佳彦, 川村久美子, 荒川宜親, 長野則之
Organizer
第47回薬剤耐性菌研究会
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[Presentation] 愛玩動物臨床材料由来MRSAの特性解析; ヒト臨床材料由来株との系統発生学的比較2018
Author(s)
谷口唯, 小出将太, 前山佳彦, 林航, 田中隼斗, 飯村将樹, 玉井清子, 鈴木匡弘, 長野由紀子, 荒川宜親, 長野則之
Organizer
第47回薬剤耐性菌研究会
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[Presentation] 洗浄用シンクより検出されたNDM-1産生Acinetobacter pittii の解析2018
Author(s)
春日恵理子, 名取達矢, 林航, 長野由紀子, 長野則之, 堀内一樹, 根岸達哉, 松岡美 奈, 樋口祥子, 松本剛, 本田孝行
Organizer
第47回薬剤耐性菌研究会
