2019 Fiscal Year Research-status Report
次世代シーケンス技術を用いた、若年発症糖尿病の新規原因遺伝子解明
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18K08509
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
田中 大祐 京都大学, 医学研究科, 助教 (50582904)
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2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 糖尿病 / 家族性若年糖尿病 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
35歳未満での若年発症糖尿病患者につき、DNA検体および臨床情報を収集した。このうち、30歳未満発症で肥満歴がない、13名の全エクソンシーケンス[WES]を行った。この13名には既知の家族性若年糖尿病[MODY]原因変異が存在しないことが確認済みである。
WESのデータから、データベース(1000 genomesおよび Human Genetic Variation Database双方)におけるアレル頻度が0.01未満であり、in silico解析にて疾患発症原因となる可能性が高い変異(SNPEffにてHIGHまたは MODERATEであり、かつ CADD[Combined Annotation Dependent Depletion]にてPHRED scoreが20以上)を抽出した。結果、単一遺伝子糖尿病との関連が知られている35遺伝子に、計6個の変異が4名に見いだされた(患者1; WFS1遺伝子K193del変異, 患者2; PTF1A遺伝子変異S18F変異, 患者3; HNF1A遺伝子G191D変異, GLIS3遺伝子Q450H変異, CFTR遺伝子A399V変異, 患者4; PPARG遺伝子Y173fs変異 いずれもHeterozygote)。うちPTF1A遺伝子変異S18F変異は、患者2および、同じく若年発症糖尿病に罹患した血縁者2名に共有されており、変異が発症原因である可能性が強く示唆された。このため、同変異がPTF1Aの転写活性に与える影響をin vitroで検討すべく、レポーターアッセイに用いるベクターを海外の研究者から譲受し、細胞を用いた検討を開始した。
また、前述以外にも、35歳未満での若年発症糖尿病患者で既知MODY原因変異のない19名のWESが完了しており、前述の13名とあわせ計32名がシーケンス済みであり、現在データの分析中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
多数の患者に関する全エクソンシーケンスデータの分析および、それにより同定された発症原因遺伝子候補のin vitro解析に進むことができていることから、順調であると判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
ひきつづき症例の集積を行い、全エクソンシーケンスを行ってデータを分析し、それにより同定された発症原因遺伝子候補のin vitro, in vivo解析を進展させる。
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Research Products
(3 results)
