2018 Fiscal Year Research-status Report
１型糖尿病遺伝子の同定と解析：濃厚発症家系における全エクソームシークエンス
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18K08530
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| Research Institution | Kindai University |
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Principal Investigator |
池上 博司 近畿大学, 医学部, 教授 (20221062)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
馬場谷 成 近畿大学, 医学部, 講師 (10449837)
廣峰 義久 近畿大学, 医学部, 講師 (30460851)
川畑 由美子 近畿大学, 医学部, 准教授 (80423185)
能宗 伸輔 近畿大学, 医学部, 講師 (90460849)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | １型糖尿病 / 遺伝子 / 全エクソ－ムシークエンス / 濃厚家系 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では１型糖尿病の成因を分子レベルで解明し、それに基づいた予知・予防・根治療法の構築・確率を目的として、分子遺伝学的アプローチを駆使して１型糖尿病の疾患感受性遺伝子の同定・解析を進めた。
これまでに全国規模で収集を進めてきた濃厚発症家系においては、次世代シーケンス技術を用いて全エクソン塩基配列解析を行い、rare variantの同定を進めている。また、多数の症例・対照におけるゲノムワイド関連解析（GWAS）も並行して行い、多くの症例に共通するありふれた多型（common variant）の同定・解析を進めた。
rare variantの解析では家系内に３名以上の患者を有する濃厚家系の構成員（2n=66）と孤発の１型糖尿病孤発例（2n=676）、健常対照者（2n=792）を比較解析した結果、濃厚家系ではHLA-DR8ハプロタイプ（DRB1*08:02-DQB1 *03:02）が極めて高率であることが明らかとなった。HLA以外の新規遺伝子座を同定する目的で、濃厚家系における構成員のエクソームシークエンスを完了し、原因となる変異・多型の絞り込みを進めている。
common variant の解析では全国規模で集積した多数例の劇症１型糖尿病を対象としてGWAS解析を完了し、HLA以外にゲインムワイドの有意水準をクリアする新たな遺伝子を染色体12q13.13に同定し、報告した（Diabetes 68:665-675, 2019）.
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ほぼ当初の予定通り進捗。
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| Strategy for Future Research Activity |
濃厚発症家系の集積を継続するとともに、全エクソームシークエンスの結果の絞り込み、原因遺伝子の同定を推進する。
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[Journal Article] A genome-wide association study confirming a strong effect of HLA and identifying variants in CSAD/lnc-ITGB7-1 on chromosome 12q13.13 associated with susceptibility to fulminant type 1 diabetes.2019
Author(s)
Kawabata Y, Nishida N, Awata T, Kawasaki E, Imagawa A, Shimada A, Osawa H, Tanaka S, Takahashi K, Nagata M, Yasuda H, Uchigata Y, Kajio H, Makino H, Yasuda K, Kobayashi T, Hanafusa T, Tokunaga K, Ikegami H
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Journal Title
Diabetes
Volume: 68
Pages: 665-675
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Diffusion-weighted magnetic resonance imaging in the pancreas of fulminant type 1 diabetes2018
Author(s)
Tokunaga A, Imagawa A, Nishio H, Hayata S, Shimomura I, Abiru N, Awata T, Ikegami H, Uchigata Y, Oikawa Y, Osawa H, Kajio H, Kawasaki E, Kawabata Y, Kozawa J, Shimada A, Takahashi K, Tanaka S, Chujo D, Fukui T, Miura J, Yasuda K, Yasuda H, Kobayashi T, Hanafusa T
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Journal Title
Diabetology International
Volume: 9
Pages: 257-265
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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