2019 Fiscal Year Research-status Report
1型糖尿病遺伝子の同定と解析:濃厚発症家系における全エクソームシークエンス
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18K08530
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Research Institution | Kindai University |
Principal Investigator |
池上 博司 近畿大学, 医学部, 教授 (20221062)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
馬場谷 成 近畿大学, 医学部, 講師 (10449837)
廣峰 義久 近畿大学, 医学部, 講師 (30460851)
川畑 由美子 近畿大学, 医学部, 准教授 (80423185) [Withdrawn]
能宗 伸輔 近畿大学, 医学部, 講師 (90460849)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | 1型糖尿病 / 遺伝子 / 分子遺伝学 / 濃厚家系 / 次世代シークエンス / ゲノムワイド関連解析 / rare variant / common variant |
Outline of Annual Research Achievements |
※本研究では1型糖尿病の成因を分子レベルで解明し、それに基づいた予知・予防・根治療法の構築・確率を目的として、分子遺伝学的アプローチを駆使して1型糖尿病の疾患感受性遺伝子の同定・解析を進めた。多くの症例に共通するありふれた多型(common variant)の同定を目的としたゲノムワイド関連解析(GWAS解析)と、全国規模で収集を進めてきた濃厚発症家系を対象とした次世代シーケンス技術による全エクソン塩基配列解析(全エクソームシークエンス)によるrare variantの同定を並行して進めてきた。GWASによるcommon variant の解析ではオールジャパンで集積した多数例の劇症1型糖尿病を対象としたGWAS解析の結果、ゲノムワイドの有意水準をクリアする新たなnon-HLA遺伝子を世界で初めて染色体12q13.13に同定した。この遺伝子はクラシカルな自己免疫性1型糖尿病とは関連を示さないことから、1型糖尿病の劇症化に関与する重要な遺伝子と考えられ、その分子メカニズムの解析を現在進めているところである。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ほぼ当初の予定通り進捗。
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Strategy for Future Research Activity |
追加集積した濃厚発症家系の全エクソームシークエンスを進め、rare variantの抽出を行うとともに、全家系の結果を統合して責任遺伝子の抽出、同定を進める。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Conditions, pathogenesis, and progression of diabetic kidney disease and early decliner in Japan2020
Author(s)
Yoshida Y, Kashiwabara K, Hirakawa Y, Tanaka T, Noso S, Ikegami H, Ohsugi M, Ueki K, Mita T, Watada H, Koya D, Mise K, Wada J, Shimizu M, Wada T, Ito Y, Narita I, Kashihara N, Nangaku M, Matsuyama Y
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Journal Title
BMJ Open Diabetes Research & Care
Volume: 8
Pages: 1-8
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Contribution of Asian Haplotype of KCNJ18 to Susceptibility to and Ethnic Differences in Thyrotoxic Periodic Paralysis2019
Author(s)
Noso S, Babaya N, Hiromine Y, Ito H, Taketomo Y, Yoshida S, Niwano F, Monobe K, Minohara T, Okada T, Tsugawa M, Kawabata Y, Ikegami H
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Journal Title
The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism
Volume: 104
Pages: 6338-6344
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Hyperglycemia in non-obese patients with type 2 diabetes is associated with low muscle mass: The Multicenter Study for Clarifying Evidence for Sarcopenia in Patients with Diabetes Mellitus2019
Author(s)
Sugimoto K, Tabara Y, Ikegami H, Takata Y, Kamide K, Ikezoe T, Kiyoshige E, Makutani Y, Onuma H, Gondo Y, Ikebe K, Ichihashi N, Tsuboyama T, Matsuda F, Kohara K, Kabayama M, Fukuda M, Katsuya T, Osawa H, Hiromine Y, Rakugi H
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Journal Title
Journal of Diabetes Investigation
Volume: 10
Pages: 1471-1479
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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