2018 Fiscal Year Research-status Report
急性胆道炎に対する自動多項目同時遺伝子システムを用いた新規起因菌同定法の開発
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18K08633
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| Research Institution | Toho University |
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Principal Investigator |
浅井 浩司 東邦大学, 医学部, 講師 (20366454)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鯨岡 学 東邦大学, 医学部, レジデント (00807092)
片桐 美和 東邦大学, 医学部, 助教 (90385667)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 急性胆道炎 / メタゲノム解析 / 自動多項目同時遺伝子検出 / 抗菌薬感受性 / 多剤耐性菌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
薬剤耐性菌の世界的蔓延はこれまでの過剰な抗菌薬使用が原因であることに異論はない．急性胆道炎の起因菌として検出頻度の高い腸内細菌においても，薬剤耐性菌の検出頻度は増加傾向にある．例えば，急性胆道炎の起因菌として高率に検出されるEscherichia coliやKlebsiella spp.においても，近年では高率にextended spectrum β-lactamase (ESBL)産生菌が検出される．これらの細菌は抗菌薬治療で汎用されるセファロスポリン系，ペニシリン系，フルオロキノロン系抗菌薬の効果が期待できない．世界的に見ても多剤耐性菌の検出頻度も増加しており，今後これらの耐性菌がさらに増加することが予想される．また，国内においては徐々に進んでいる高齢化に伴い，薬剤耐性菌が高率に検出される医療関連感染の増加も危惧される．
これまでわれわれは急性胆道炎症例にメタゲノム解析を行い，24時間以内に従来の細菌検査と一致した結果を網羅的に得られることを確認したが，ESBL産生菌の同定にはさらに24時間を要した．従来の細菌検査法よりは短期間で細菌同定・耐性状況を確認できるメタゲノム解析であるが，このタイムロスは容易に敗血症に陥る可能性のある一刻を争う急性胆道炎においては致命的となる可能性がある．よって，メタゲノム解析よりも，さらに一層迅速に起因菌を同定し，かつその耐性状況を判別するための技術確立に向けた基礎的研究の遂行は急務と考えられた．
今回立案した基礎研究は自動多項目同時遺伝子検査システムを用いた細菌同定システムの解析である．現在，100例を超える症例集積を行い，現在も症例集積を行っている．現在のところ，良好な一致率を確認し，途中経過に関して学会発表を行った．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現在も症例集積を行っている段階である．ほぼ予定通り症例集積を行い，自動多項目検出システムによる解析を行っているが，この結果を裏付けるメタゲノム解析に関しては，若干の遅れをとっているため．
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| Strategy for Future Research Activity |
本年度もこれまで通り症例集積を行っていくと同時に，解析結果の裏付け作業をメタゲノム解析手法を用いて行っていく予定である．
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| Causes of Carryover |
旅費が予定よりも抑えられたため若干の未使用額が生じた．この費用は次年度の解析に用いるパネル費用(消耗品代），英文校正費用に使用予定である．
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[Presentation] Comprehensive diagnostic method for acute cholecystitis using metagenomic approach2018
Author(s)
Kujiraoka M, Kuroda M, Asai K, Watanabe M, Matsukiyo H, Saito T, Moriyama H, Enomoto T, Okamoto Y, Saida Y, Kusachi S
Organizer
The International College of Surgeons, The 64st Annual Congress of the Japanese Section
Int'l Joint Research
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