2018 Fiscal Year Research-status Report
大腸がんの腫瘍免疫応答を決める遺伝的背景因子と局所がん微小環境因子
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18K08649
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
黒田 陽介 九州大学, 大学病院, 助教 (10779995)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | アームコピー数変異 / 突然変異 / ネオアンチゲン / 腫瘍免疫応答 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
大腸がんは遺伝的背景（と環境要因と）が結腸・直腸局所に影響を及ぼしゲノムレベルの変異を来しそれが蓄積して生じる三位一体の病態であると考えられている。したがって遺伝子多型で決まる遺伝学的背景が、発がん時のみならず病変切除後の経過においても患者の再発予後に影響を及ぼしうることについて明らかにすることを目的とした。
平成30年度は以下の如く研究を推進し成果を得た。
大腸がん(再発)8例と 非再発10例の原発巣について、ゲノムDNA (WES)およびtotal RNA抽出(RNA SeqおよびTCR repatoires)を実施した。再発陽性大腸がん症例は非再発大腸がんに比べてSNV数が少なく、また推察される抗原性を比較したところ後者において高い抗原性を示した。またコピー数変異(CNA)は有意に再発原発巣>非再発原発巣 (p< 2.2e-16)であった。この結果を検証するためにTCGAデータで大腸がん(409例)におけるCNAとSNV数を比較したところ、全ゲノム領域では有意差は認めなかったが、染色体7番、20番、13番に限ると、アームレベルのCNAとSNVとは逆相関をしており、aneuploidyになると検出されるSNVが減少することを明らかにして、自験例を支持していた。また、アームレベルCNAと腫瘍免疫応答を評価する指標として知られる(cytolytic activity; CYT)とが逆相関することを示しており(Rooney et al. Cell 2015)、コピー数の増加により腫瘍免疫応答が低下することを明らかにした。さらにR＋群はR-群にくらべて、腫瘍免疫応答関連分子群(CD8, CD4, PD1, PDL1, CTLA4, FOXP3, CD25, CCR4)の発現が低下していることを明らかにした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
遺伝子多型で決まる遺伝学的背景が、発がん時のみならず病変切除後の経過においても患者の再発予後に影響を及ぼしうることについて明らかにすることを目的とし、大腸がん(再発)8例と 非再発10例の原発巣について、ゲノムDNA (WES)およびtotal RNA抽出(RNA SeqおよびTCR repatoires)を実施し、研究成果を得つつある。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度は、原発巣と転移巣とを比較し、CNAが転移再発にむけての選択圧となっているか？否かについて明らかにする。また、遺伝学的背景(SNP)との関係性についても明らかにする。
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| Causes of Carryover |
平成31年度に研究消耗品として利用する予定。
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[Journal Article] A clinical trial of somatic and germline analyses for healthy longevity in a postoperative cancer patient.2019
Author(s)
Hayashi N, Kuroda Y, Saito T, Tsuruda Y, Niida A, Otsu H, Eguchi H, Masuda T, Suzuki Y, Natsugoe S, Mimori K.
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Journal Title
Surg Today.
Volume: 49(9)
Pages: 738-747
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Prognostic Impact of Immune-Related Gene Expression in Preoperative Peripheral Blood from Gastric Cancer Patients.2018
Author(s)
to S, Fukagawa T, Noda M, Hu Q, Nambara S, Shimizu D, Kuroda Y, Eguchi H, Masuda T, Sato T, Katai H, Sasako M, Mimori K.
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Journal Title
Ann Surg Oncol
Volume: 25(12)
Pages: 3755-3763
DOI
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[Journal Article] Identification of ARL4C as a Peritoneal Dissemination-Associated Gene and Its Clinical Significance in Gastric Cancer.2018
Author(s)
Hu Q, Masuda T, Sato K, Tobo T, Nambara S, Kidogami S, Hayashi N, Kuroda Y, Ito S, Eguchi H, Saeki H, Oki E, Maehara Y, Mimori K.
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Journal Title
Ann Surg Oncol.
Volume: 25(3)
Pages: 745-753
DOI
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[Presentation] Circulating exosomal miR-203 is associated with metastasis via inducing tumor-associated macrophages in colorectal cancer2018
Author(s)
D Shimizu, T Masuda, Y Takano, H Iinuma, R Yamaguchi, K Sato, T Tobo, H Hirata, Y Kuroda, S Nambara, N Hayashi, T Iguchi, S Ito, H Eguchi, T Ochiya, K Yanaga, S Miyano, K Mimori.
Organizer
AACR Annual Meeting 2018
Int'l Joint Research
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