2018 Fiscal Year Research-status Report

消化器がんリスク関連機能SNPの解析及びその臨床応用

Research Project

Project/Area Number	18K08665
Research Institution	Chiba Cancer Center (Research Institute)
Principal Investigator	中村洋子千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 主席研究員 (60260254)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	下里修千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター腫瘍ゲノム研究室, 室長心得 (30344063) 巽康年千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター腫瘍ゲノム研究室, 研究員 (00450578)
Project Period (FY)	2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords	がん / 遺伝子 / ゲノム / SNP / がん予防
Outline of Annual Research Achievements	これまでの研究から、8000名以上の健常者に対して前向きコホート調査を約12年間継続し、比較的若年で消化器がんを発症したリスク群、70歳までがんを発症せず、かつ家族歴もない非リスク群に対し409がん関連遺伝子のエクソーム解析を行い、リスク候補の3遺伝子に機能性SNPを同定した。SNPと体細胞変異Signature や臨床所見との関連、サロゲートマーカーとしての可能性、がん予防、診断、予後予測、治療法等への利用可能性を追求するとともに、分子生物学的機能解析を試み、発がん感受性への関与の解明を計ることを目的としている。同定された遺伝子AのSNPに着目し、コホート検体の胃がん40症例、臨床胃がん検体105症例から、それぞれ5症例、9症例に遺伝子AのSNPを見出した。一方、コホート検体の非がん症例では、遺伝子AのSNPが認められるか検討中である。さらに、遺伝子Aを単離し人工的に変異を導入して胃がん細胞株に発現させ、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化を調べるため、変異導入遺伝子の構築を行っている。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason SNP解析により胃がんに関連の深い遺伝子Aを見出した。この遺伝子の胃がんに対する機能を解析するため、人工的に変異を導入して胃がん細胞株に発現させる準備を進めることが出来た。コホート検体及び臨床検体を用いて、遺伝子AのSNP解析を進めることが出来、さらには、胃がんや大腸がん検体でGWAS解析を行う準備が整った。
Strategy for Future Research Activity	今後は、遺伝子AのSNP解析を非がんにおいても行い、胃がん検体での遺伝子AのSNP解析と合わせ、がんとの関連を検討する。遺伝子Aの機能解析を行うため、培養細胞に構築した変異遺伝子Aを導入し、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化を調べる。
Causes of Carryover	次年度、非がん検体数及びがん検体数を増やし、さらに遺伝子AのSNPk解析を行う。また、遺伝子Aの機能解析を行うため、今年度は細胞に導入する遺伝子Aの構築を行ったので、次年度は培養細胞に遺伝子Aを導入し、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化を調べる予定であるが、構築遺伝子Aを何パターンか作成し行う。