2019 Fiscal Year Research-status Report
消化器がんリスク関連機能SNPの解析及びその臨床応用
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18K08665
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| Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
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Principal Investigator |
中村 洋子 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 主席研究員 (60260254)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
下里 修 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター 腫瘍ゲノム研究室, 室長 (30344063)
巽 康年 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター 腫瘍ゲノム研究室, 研究員 (00450578)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | がん / 遺伝子 / ゲノム / SNP / がん予防 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでの研究から、8000名以上の健常者に対して前向きコホート調査を約13年間継続し、比較的若年で消化器がんを発症したリスク群、70歳までがんを発症せず、かつ家族歴もない非リスク群に対し409がん関連遺伝子のエクソーム解析を行い、リスク候補の3遺伝子に機能性SNPを同定した。本研究では、全国10万人J-MICCコホートと連携した検討及び過去の当施設での消化器がん症例400例をreplication cohortとして、遺伝統計学的解析を進めている。腫瘍体細胞変異に関しても全エクソームを解析し、臨床所見などについても多変量解析を加え、リスク候補の3遺伝子機能性リスクSNPと体細胞変異Signature や臨床所見との関連、サロゲートマーカーとしての可能性、がん予防、診断、予後予測、治療法等への利用可能性を追求するとともに、分子生物学的機能解析を試み、発がん感受性への関与の解明を計ることを目的としている。
遺伝子多型解析の結果、リスク候補の3遺伝子のうち、胃がんに関連した遺伝子AのSNPに着目した。さらに、臨床胃がん検体105症例についても遺伝子AのSNP解析を行い、コホート検体の胃がん40症例、臨床胃がん検体105症例から、それぞれ5症例、9症例に遺伝子AのSNPを見出した。また、胃がん症例数、非がん症例数を増やし、遺伝子AのSNP解析を行い、非がん症例でも遺伝子AにSNPが認められる理由について検討を行っている。さらに、遺伝子Aを単離し人工的に変異を導入して胃がん細胞株に発現させ、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化を調べるため、変異導入遺伝子の構築を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
SNP解析により胃がんに関連の深い遺伝子Aを見出した。この遺伝子の胃がんに対する機能を解析するため、人工的に変異を導入した遺伝子Aを作成し、胃がん細胞株に発現させた。その結果、変異を導入していない遺伝子Aと変異を導入したい遺伝子Aの細胞増殖能に対する差が認められた。
また、遺伝子Aを過剰発現させた細胞株より遺伝子Aと関連のあるいくつかの遺伝子が見出された。
胃がん症例における遺伝子Aを含むいくつかの遺伝子の発現を調べたところ、生存率と関連した遺伝子の発現パターンが認められた。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、非がん検体で遺伝子AのSNP解析を行った結果について検討し、非がんで遺伝子AのSNPが認められる理由を検討する。さらに、胃がん以外のがんにおいても遺伝子AのSNPが認められるか検討を行う。
胃がん症例において遺伝子Aを含めいくつかの遺伝子発現解析を行った。その遺伝子発現パターンと臨床情報等の因子との相関を調べ、胃がんとその遺伝子との関連を検討する。
遺伝子Aの機能解析を行うため、培養細胞に構築した変異遺伝子Aを導入し、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化をさらに調べる。
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| Causes of Carryover |
次年度、胃がん以外のがん検体についても遺伝子AのSNP解析を拡大し行うため、遺伝子配列解析等の試薬、キット等の購入が必要である。
また、非がん検体数を増やし、遺伝子AのSNP解析を行い、その結果が意味するところを検討するため。
培養細胞に遺伝子Aを導入し、細胞増殖率や腫瘍形成率あるいは薬剤に対する感受性などの形質変化および関連遺伝子の発現パターン変化を前年度に続き調べるため、細胞培養関連の試薬、キット等が必要である。
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[Journal Article] A Nobel Multivariate Index for Cancer Risk Detection Based On the Serum Trace Elements: Metallo-Balance Method2020
Author(s)
Naoyuki Okamoto1, Haruo Mikami2, Yohko Nakamura2, Miho Kusakabe2, Naohito Yamamoto3, Nobuhiro Takiguchi4, Yoshihiro Nabeya5, Hiroaki Soda6, Satoshi Fukasawa7 Takeshi Kishida8, Manabu Shiozawa9, Akira Yoshida10, Takuya Shimizu1, Shunsuke Fujimoto1, Mitsuhiro Ueda1, Seiichi Inagaki1 Yohei Miyagi11, Hiroki Nagase2
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Journal Title
Journal of Cancer Epidemiology and Prevention
Volume: 5
Pages: 1
DOI
Peer Reviewed
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