2018 Fiscal Year Research-status Report
網羅的エピゲノム・トランスクリプトーム解析による肝炎治癒後肝発癌機序の解明
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18K08722
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| Research Institution | National Hospital Organization, Kyushu Cancer Center |
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Principal Investigator |
杉町 圭史 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医長 (90452763)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井口 友宏 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医師 (30598959)
三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
吉住 朋晴 九州大学, 医学研究院, 准教授 (80363373)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 肝細胞癌 / ウイルス学的著効 / エピゲノム / メチル化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
C 型肝炎ウイルス治療後の肝癌発生の分子機序を解明することを目指して研究を開始した。現在まで肝細胞癌に対する肝切除手術を行った症例について、切除標本の癌部、非癌部の新鮮凍結標本を採取した。また手術前、手術後１週間後、その後3ヶ月毎に末梢静脈血より血漿を採取し、凍結保存を行なった。研究対象症例の病理組織学的情報、臨床情報を取得した。各症例の凍結組織よりそれぞれゲノムDNA と全RNA を抽出し精製した。これらの症例のDNAよりエピゲノムメチル化解析を行うため、ターゲットメチローム用の鋳型調整を開始した。切除標本の解析と並行して、肝癌培養細胞における解析を開始した。2株の肝癌培養細胞をバイサルファイト処理し、universalに脱メチル化処理し、肝癌培養細胞においてメチル化異常を来している遺伝子を同定している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
臨床検体について想定通りにサンプリングが進んでいる。核酸抽出を行い全ゲノムメチル化解析の準備が進んでいる。2年目以降に行う予定だった肝癌培養細胞の解析も前倒しで開始している。
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| Strategy for Future Research Activity |
概ね当初の研究計画に準じて研究を進める予定である。2年目となる平成31年度は、採取したサンプルよりPBAT(post-bisulfate adaptor-tagging)法を用いた網羅的DNAメチル化シークエンシングとmRNAシークエンシング(RNAseq)を重点的に進める予定である。
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| Causes of Carryover |
研究分担者（三森功士）が行なった核酸抽出費用について、試薬の納品が平成３１年度になったため次年度使用となった。
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