2019 Fiscal Year Research-status Report
Genome-wide association study to elucidate genetic pathogenesis of chronic postoperative pain
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18K08829
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| Research Institution | Juntendo University |
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Principal Investigator |
林田 眞和 順天堂大学, 医学部, 教授 (80251289)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池田 和隆 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 分野長 (60281656)
西澤 大輔 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80450584)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 遺伝子多型 / 腹腔鏡下婦人科手術 / 術後痛 / 遷延性術後痛 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
症例数としては全部で400症例の集積を目指し、2019年度内に目標400症例中、289症例において疼痛関連臨床データとゲノムDNA試料の採取を終了した。前半200症例においてInfinium OmniExpressExome-8 BeadChip Kit （イルミナ社）等の高密度アレイを用いた約100 万箇所の網羅的SNPs ジェノタイピングを行って統計解析用の遺伝子データを準備し、術後痛など疼痛関連表現型と、約100万箇所のSNPsとの関連を検討するゲノムワイド関連解析(GWAS)を実施し、表現型と密接に関連するSNPsを遺漏なく検出し、有力候補SNPs(causativeと考えられるSNPs)を同定する計画を立てた。また、後半症例ではGWASで見出された有力候補SNPsに焦点を絞ったTaqman法を用いた個別解析を行い、GWASの結果を追試する計画を立てた。
症例数としては当初400症例の集積を目指していたが、350例で一定の成果が出せる目途がついたため、2019年度内に350症例の疼痛関連臨床データとゲノムDNA試料の採取し、それにて患者の募集を終了した。
2019年度において科学研究費によって高密度アレイを購入し、前半200症例において術後痛スコアなどの疼痛関連表現型データと、約100万箇所の遺伝子多型(SNPs)との関連を検討するGWASを実施した。その結果、表現型と密接に関連するSNPsを遺漏なく検出し、有力候補SNPsが複数同定された。現在、後半150症例においてGWASで見出された有力候補SNPsに焦点を絞った解析をTaqman 法にる個別解析を実施する事によってGWASの結果を追試中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
350症例において疼痛関連臨床データとゲノムDNA試料の採取を終了し、これにて患者募集は終了した。科研費で購入した網羅解析用チップを使用し、200症例において全ゲノム領域の約100万箇所の遺伝子多型(SNPs)の網羅解析を実施し、いくつかの候補SNPsを同定した。後半150例において前半200例で検出された、候補SNPsに関して個別解析によって追試を施行中である。
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| Strategy for Future Research Activity |
2019年度内に350症例分の臨床データ及びゲノムDNA試料の収集を完了した。2020年度内に疼痛関連表現型に影響するSNPsの同定を完了させ、学会および論文で公表する予定である。
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| Causes of Carryover |
網羅的遺伝子多型解析用チップ(高密度アレイ)の価格が年々安価となっており、申請時に予測した金額より安価で購入できた。このため差額が生じた。2020年度に統計解析ソフト購入に充当予定がある。
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Research Products
(10 results)
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[Presentation] Associations between genetic polymorphisms on chromosome 14q32 and effects of opioid analgesics and chronic pain.2019
Author(s)
Kosaki Y, Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Nakayama K, Ebata Y, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019), Fukuoka [2019/10/12].
Int'l Joint Research
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[Presentation] Genome-wide association studies on chronic pain and effects of drugs for the treatment of pain.2019
Author(s)
Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Ebata Y, Nakayama K, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019), Fukuoka [2019/10/13].
Int'l Joint Research
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[Presentation] Association between the rs11726196 Single-Nucleotide Polymorphism within the Transient Receptor Subfamily C Member 3 (TRPC3) Gene and Chronic Pain.2019
Author(s)
Aoki Y, Nishizawa D, Yoshida K, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Hasegawa J, Kasai S, Takahashi K, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
6th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP2019), Fukuoka [2019/10/13].
Int'l Joint Research
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[Presentation] Genome-wide association study identifies genetic polymorphisms and genes possibly associated with chronic pain and postherpetic neuralgia.2019
Author(s)
Nishizawa D, Arita H, Hanaoka K, Yajima C, Iseki M, Kato J, Ogawa S, Hiranuma A, Kasai S, Hasegawa J, Ebata Y, Nakayama K, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
The 69th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics (ASHG2019), Houston, USA [2019/10/17]
Int'l Joint Research
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[Presentation] ゲノムワイド関連解析(GWAS)による慢性痛及び帯状疱疹後神経痛感受性遺伝子の同定.2019
Author(s)
西澤大輔, 有田英子, 花岡一雄, 矢島直, 井関雅子, 加藤実, 小川節郎, 平沼彩子, 笠井慎也, 長谷川準子, 江畑裕子, 中山京子, 林田眞和, 池田和隆
Organizer
日本人類遺伝学会第64回大会, 長崎 [2019/11/07].
