2020 Fiscal Year Annual Research Report

Systematic re-estimation of polymorphism of T. pallidum genome from wider range of specimens including T. p DNA of lower copy numbers

Research Project

Project/Area Number	18K09184
Research Institution	National Institute of Infectious Diseases
Principal Investigator	中山周一国立感染症研究所, 細菌第一部, 主任研究官 (80280767)
Project Period (FY)	2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords	近縁系統株を細分可能なSNP
Outline of Annual Research Achievements	課題目標に沿って、2018年以前の検体群とも合わせ、従前から継続している分子型別、耐性サーベーランスの2017~2018年の集計結果をまとめた。また、2014~2018年の国内梅毒トレポネーマDNAのゲノムシーケンス解析結果を投稿論文で公表した。この論文において、課題の目標の１つとしていた近縁関係にある株群、今回は日本株と中国株とをほぼ細分化できる１塩基置換を同定した。またこれとは別に2020年初頭から、Washington大、L. Giacani主導の、梅毒ワクチン開発を目指した世界各国の梅毒トレポネーマゲノム解析プロジェクトに参加して2019年1月~2020年2月までの日本国内陽性例82サンプルを共有し、共同でデータ解析を行っている。