2020 Fiscal Year Annual Research Report
Sensorineural hearing loss caused by genomic alteration
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18K09343
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| Research Institution | Shinshu University |
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Principal Investigator |
茂木 英明 信州大学, 医学部附属病院, 医員 (60422698)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | ゲノム構造変化 / 遺伝子コピー数 / 次世代シークエンサー / 難聴 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
天性感音難聴においては、遺伝子上のひとつの塩基ないしは数塩基の、点変異、欠失や挿入による変異が原因となる。近年、これに加えて、コピー数変化(CNV: copy number variation)といわれる、より大きな規模での遺伝子の重複や欠失が、難聴の原因となることが明らかになりつつある。 このCNVを網羅的に、複数の候補遺伝子から検出するために、次世代シークエンサーのリードデータから、簡便にCNVを検出する方法を確立した。これを一次スクリーニングとし、確認のため、aCGH(比較ゲノムハイブリダイゼーション法)を利用したマイクロアレイで検証を行った。次世代シークエンサーからCNV候補を見出し、複数の難聴遺伝子におけるCNVに対して、本CGHアレイを用いた確認を行い、検討した。次世代シークエンサーのリードデータからのCNV検出はほぼ可能であることが示された。複数の難聴遺伝子において、大きなゲノム領域の欠失などのCNVを原因とする難聴家系を確認することができた。
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[Journal Article] Identification of a Novel Copy Number Variation of EYA4 Causing Autosomal Dominant Non-Syndromic Hearing Loss2021
Author(s)
Ishino T, Ogawa Y, Sonoyama T, Taruya T, Kono T, Hamamoto T, Ueda T, Takeno S, Moteki H, Nishio SY, Usami SI, Nagano Y, Yoshimura A, Yoshikawa K, Kato M, Ichimoto M, Watanabe R
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Journal Title
Otology and Neurotology
Volume: 14
Pages: －
DOI
Peer Reviewed
