2020 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of transcriptional dysregulation by super-enhancer and oral squamous cell carcinoma progression
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18K09545
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| Research Institution | Kamakura Women's University |
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Principal Investigator |
櫻井 浩平 鎌倉女子大学, 家政学部, 准教授 (10608756)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 口腔癌 / 扁平上皮癌 / 高転移能亜株 / 転写制御 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
舌由来の扁平上皮癌細胞株HSC-3細胞と、HSC-3細胞から樹立された高転移能亜株HSC-3-M3細胞（Oral Oncol. 1998, 34(4):235-6）を、Japanese Collection of Research Bioresources（JCRB）細胞バンクから入手した。これらの細胞からDNAを抽出してshort tandem repeat（STR）を比較解析し、2つの細胞が同一人物由来であることを確認した。
次にHSC-3細胞とHSC-3-M3細胞から抽出したtotal RNAを用いて、SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60k v3 Microarray（Agilent）によって遺伝子発現を網羅解析した。その結果、HSC-3細胞とHSC-3-M3細胞では1182個の発現変動RNAが見出された。一方でSurePrint G3 Human miRNA Microarray 8x60K（Agilent）によってmicroRNAの発現も解析したが、発現変動microRNAはわずか数個であった。
1182個の発現変動 RNAリストを用いて、Ingenuity Pathway Analysis（IPA）を行ったところ、転移を誘導する遺伝子ネットワークが予想された。さらにHSC-3-M3細胞ではNF-kBが活性化されている可能性が示唆されたため、NFkB Phospho Antibody Microarray（Full Moon Biosystems）を行ったところ、NF-kB経路に関する、いくつかのタンパク質がHSC-3-M3細胞において特異的にリン酸化されていることが明らかとなった。
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