2018 Fiscal Year Research-status Report
重症感染症を引き起こす多剤耐性菌のハイパービルレンスの解明と臨床への応用
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18K10030
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| Research Institution | Teikyo University |
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Principal Investigator |
西田 智 帝京大学, 医学部, 講師 (10409386)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
斧 康雄 帝京大学, 医学部, 教授 (10177272)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 多剤耐性菌 / ハイパービルレンス / アシネトバクター / 肺炎桿菌 / 病原性 / WGS |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、アシネトバクターや肺炎桿菌は多剤耐性の獲得と院内感染を引き起こすことから国内外で社会的な問題となっている。本研究は重症感染症を引き起こす多剤耐性菌のハイパービルレンスに関わる因子を同定して迅速診断や化学療法の新しい標的を発見することを目的とする。
本研究では、臨床分離された薬剤耐性株のハイパービルレンスを決定する因子をゲノムシーケンス解析、遺伝子クローニング、感染実験によって明らかにすることを試みる。解析対象は多剤耐性Acinetobacter baumannii (MDRA)、KPC-2産生多剤耐性肺炎桿菌、NDM-1産生多剤耐性肺炎桿菌、NDM-5産生多剤耐性大腸菌とする。
本年度は多剤耐性Acinetobacter baumannii (MDRA) 3株、KPC-2産生多剤耐性肺炎桿菌 1株、NDM-1産生多剤耐性肺炎桿菌 1株、NDM-5産生多剤耐性大腸菌 1株の全ゲノム解析 (WGS) を行った。また、新たにOXA-48産生多剤耐性大腸菌を分離したので、1株のWGSを行った。また、アウトブレイクを起こしたMDRAの中にハイパービルレンスなものが存在することを感染実験により証明した。海外からの患者の監視培養で分離されたカルバペネマーゼ産生菌の中にもハイパービルレンスであるものを見出した。更に、病原性遺伝子をシャトルベクターへクローニングし、非病原性株へ導入することによって病原性が獲得されるかどうかを感染モデルで確認した。
来年度は、引き続きWGSを行うとともに、病原性因子の機能解析を行う。さらに病原性遺伝子の発現を抑制する薬剤の探索を行う予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、臨床分離された薬剤耐性株のハイパービルレンスを決定する因子をゲノムシーケンス解析、遺伝子クローニング、感染実験によって明らかにすることを試みる。解析対象は多剤耐性Acinetobacter baumannii (MDRA)、KPC-2産生多剤耐性肺炎桿菌、NDM-1産生多剤耐性肺炎桿菌、NDM-5産生多剤耐性大腸菌とする。
本年度は多剤耐性Acinetobacter baumannii (MDRA) 3株、KPC-2産生多剤耐性肺炎桿菌 1株、NDM-1産生多剤耐性肺炎桿菌 1株、NDM-5産生多剤耐性大腸菌 1株の全ゲノム解析 (WGS) を行った。また、新たにOXA-48産生多剤耐性大腸菌を分離したので、1株のWGSを行った。また、アウトブレイクを起こしたMDRAの中にハイパービルレンスなものが存在することを感染実験により証明した。海外からの患者の監視培養で分離されたカルバペネマーゼ産生菌の中にもハイパービルレンスであるものを見出した。更に、病原性遺伝子をシャトルベクターへクローニングし、非病原性株へ導入することによって病原性が獲得されるかどうかを感染モデルで確認した。
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| Strategy for Future Research Activity |
来年度は、引き続きWGSを行うとともに、病原性因子の機能解析を行う。さらに病原性遺伝子の発現を抑制する薬剤の探索を行う予定である。ゲノムが解析されている菌株との比較ゲノム解析により分子疫学的な解析と高病原性に関わる遺伝子の推定を行う。これまでの薬剤耐性遺伝子の検出法確立の経験を生かして、リアルタイムPCRやLAMP法による高病原性遺伝子の検出法を確立する。
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| Causes of Carryover |
多剤耐性高病原性株からショートリード次世代シーケンサーを用いず、ロングリード次世代シーケンサーだけで全ゲノム配列を解析する方法を確立したので計画を変更した。次年度以降はロングリード次世代シーケンサーを用いてゲノム情報を得る。
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[Presentation] 入院時監視培養により一人の患者から分離された3種のカルバペネマーゼ産生菌及び1種のESBL産生菌の分子疫学解析2019
Author(s)
西田智, 上田たかね, 祖母井庸之, 海野雄加, 鴨志田剛, 佐藤義則, 永川茂, 浅原美和, 石垣しのぶ, 古川泰司, 斧康雄
Organizer
日本感染症学会学術集会
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[Presentation] コリスチン耐性KPC産生肺炎桿菌のロングリードシーケンサーを用いた分子疫学解析2018
Author(s)
西田智, 石垣しのぶ, 浅原美和, 上田たかね, 祖母井庸之, 海野雄加, 鴨志田剛, 佐藤義則, 永川茂, 古川泰司, 斧康雄
Organizer
日本感染症学会学術集会・日本化学療法学会総会合同学会
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[Presentation] 本邦初のpan‐resistant Klebsiella pneumoniaeの全ゲノム解析2018
Author(s)
西田智, 上田たかね, 祖母井庸之, 海野雄加, 鴨志田剛, 佐藤義則, 永川茂, 石垣しのぶ, 浅原美和, 古川泰司, 斧康雄
Organizer
日本感染症学会東日本地方会学術集会・日本化学療法学会東日本支部総会合同学会
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