2020 Fiscal Year Annual Research Report
Establishment of molecular epidemiological method using resistance gene accumulation sequence of drug-resistant bacteria in multiple countries
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18K10045
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| Research Institution | Kobe Tokiwa University |
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Principal Investigator |
大澤 佳代 神戸常盤大学, 保健科学部, 教授 (50324942)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
重村 克巳 神戸大学, 保健学研究科, 准教授 (00457102)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 抗菌薬耐性 / 分子疫学 / プラスミド性 / 染色体性 / 基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ / カルバペネマーゼ / 反復配列多型解析法 / パルスフィールドゲル電気泳動法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
インドネシアで分離された基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ（ESBL）産生大腸菌について、CTX-M-15型が染色体上あるいはプラスミド上に存在しているかどうかという遺伝子局在をサザンブロットハイブリダイゼーションによって確認した。CTX-M-15遺伝子を保有する54株のうち、27株が染色体上に、20株がプラスミド上に、7株が染色体とプラスミド上に局在を示した。CTX-M-15遺伝子の染色体性とプラスミド性において菌株の系統の違いが認められた。プラスミド上にCTX-M-15遺伝子を持つESBL産生大腸菌は、ピペラシリン-タゾバクタムに対して有意に高い耐性率を示した。この結果は、Int J Urol.（2021）に掲載された。また、インドネシア株のうち、カルバぺネム耐性細菌のDNAをS1 nuclease処理後パルスフィールド電気泳動（PFGE)を実施し、プラスミドDNAバンドをそれぞれ切り出し、DNAを抽出後、次世代シークエンサーにより配列解読を実施した。解析した株からS1-PFGEによりそれぞれ1から3つずつのプラスミドバンドが確認でき、特にKlebsiella株で確認されたNDM-1型カルバペネマーゼ遺伝子をもつプラスミドには2つの系統が確認された。
インドネシア株と日本株の2国間での薬剤耐性菌の分子疫学的解析を行った。対象はインドネシアのESBL産生大腸菌115株と日本のESBL産生大腸菌72株ならびにカルバペネマーゼ産生大腸菌 23株を用いた。これらの株について、反復配列多型解析法により、細菌ゲノムにおける単一配列のタンデムリピート領域数の違いを基に菌株を型別し、薬剤耐性に関する樹形図を描き、その遺伝的類似性と相違性について比較解析し、その違いを確認した。その結果、インドネシア株と日本株において系統的な類似性をもつ株が多く認められた。
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[Journal Article] Differential effects of chromosome and plasmid bla CTX-M-15 genes on antibiotic susceptibilities in extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli isolates from patients with urinary tract infection2021
Author(s)
Yang YM, Osawa K, Kitagawa K, Hosoya S, Onishi R, Ishii A, Shirakawa T, Hirai I, Kuntaman K, Tanimoto H, Shigemura K, Fujisawa M
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Journal Title
Int J Urol.
Volume: 28
Pages: Apr 2.
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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