2019 Fiscal Year Research-status Report
The study on relationships between CLOCK gene polymorphism and childhood obesity
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18K11052
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
中島 久和 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (80363985)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 潤 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20750011)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 小児肥満 / 生体リズム / 時計遺伝子 / CLOCK / BMAL |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生活習慣と時計遺伝子の関連や影響について注目が集まっている。今回我々は生態リズムを司るとされる遺伝子CLOCKおよびBMALに焦点をあて、小児肥満との関連を調査している。肥満度20%以上の小児肥満を対象にCLOCK遺伝子およびBMAL遺伝子のの遺伝子多型(SNPs)を解析することを計画した。
CLOCK遺伝子の遺伝子多型（CLOCK SNP(s))について rs1801260 (3111T/C), rs1464490, rs3749474についてTaqman プローベを設計し、リアルタイム PCR を用いたTaqman SNP genotyping assay (Thermo Scientific 社製)にて解析を実施した。正常小児および小児肥満の研究参加者から体格測定、採血をおこなった。DNAは末梢血から抽出した。
小児肥満53例、正常対照 289例について遺伝子解析を行った。CLOCK rs1801260 (c.3111T>C)について検討した結果、Cアレルを持つ群（ジェノタイプCC+TC)はTアレルのみを持つ群（ジェノタイプ TT)に対して肥満のオッズ比 0.879 [信頼区間(95%CI), 0.447-1.731; p=0.865]の結果であった。CLOCK rs1801260遺伝子多型は小児肥満の出現に与える影響は少ないと考えられた。
CLOCK rs1464490 (T>C)に関しては、ジェノタイプTT群がジェノタイプCC+TT群に対して肥満のオッズ比が3.759 [信頼区間(95%CI), 0.447-1.731; p=0.00005]の結果で、このSNPは小児肥満の出現に関連する可能性が考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
小児肥満と時計遺伝子CLOCKの遺伝子多型との関連を調査する研究を行っている。肥満度20%以上の小児肥満を対象にCLOCK遺伝子の遺伝子多型(SNPs)を解析することを計画した。CLOCK SNPsについてrs1464490, rs3749474, rs1801260 (3111T/C), rs4580704, rs4864548などについてTaqman プローベを設計し、リアルタイム PCR を用いたTaqman SNP genotyping assay (Thermo Scientific 社製)にて解析を実施中である
小児肥満53例、正常対照 289例について遺伝子解析を行った。CLOCK rs1801260 (c.3111T>C)について検討した結果、Cアレルを持つ群（ジェノタイプCC+TC)はTアレルのみを持つ群（ジェノタイプ TT)に対して肥満のオッズ比 0.879 [信頼区間(95%CI), 0.447-1.731; p=0.865]の結果であった。CLOCK rs1801260遺伝子多型は小児肥満の出現に与える影響は少ないと考えられた。
CLOCK rs1464490 (T>C)に関しては、ジェノタイプTT群がジェノタイプCC+TT群に対して肥満のオッズ比が3.759 [信頼区間(95%CI), 0.447-1.731; p=0.00005]の結果で、このSNPは小児肥満の出現に関連する可能性が考えられた。CLOCK rs3749474 (T>C）については同様に、オッズ比1.546 [信頼区間(95%CI),0.851-2.807; p=0.164]で肥満の頻度に与える影響は限定的と考えられた。CLOCK rs4580704, CLOCK rs4864548については現在、解析中である。BMAL SNPsについても解析の計画している。
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| Strategy for Future Research Activity |
CLOCK rs4580704, CLOCK rs4864548については現在解析中であるが、症例数やSNPsでほかのrsナンバーのものも解析し、どのrsナンバーのSNPが有意義かを考察する。BMAL SNPsについても解析の計画している。さらには、CLOCK SNPs、BMAL SNPsによる体格指数、肥満症に関する血清パラメータ（血糖、HbA１c、HOMA-R, 血清脂質）に対する影響を調査する。生活パターンのアンケート調査との関連も調査することを進める。
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| Causes of Carryover |
血清検体およびゲノム検体を保存するための冷凍庫を購入予定であったが、研究室の仕様変更などがあり、次年度の予定としたため予算の余剰が生じた。令和2年度は、余剰金もあわせて検体保存用の冷凍庫の購入を予定している。また、小児では欧州や中国における既報のSNPsの検討だけでは新しい知見が得られず、新規のものも合わせ遺伝子多型を多数のTaqmanプローべので検討しなければならない。その購入予算に充当する。
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[Presentation] IGF2遺伝子変異に起因するシルバーラッセル症候群の臨床的特徴.2019
Author(s)
増永陽平, 矢本香織, 才津浩智, 井上毅信, 中川憲夫, 中島久和, 長谷川龍志, 大幡泰久, 難波範行, 鞍島有紀, 佐藤恭弘, 磯島豪, 小川英伸, 山口有, 古橋博史, 森貞直哉, 飯島一誠, 栗林良多, 鈴村宏, 藤澤泰子, 鏡雅代, 深見真紀, 緒方勤
Organizer
第92回日本内分泌学会学術集会. 令和元年5月10日, 仙台
