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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Identification of genes and their functions involved in post-zygotic hybrid inviability in Japanese flowering cherries

Research Project

Project/Area Number 18K14489
Research InstitutionForest Research and Management Organization

Principal Investigator

鶴田 燃海  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90809740)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords雑種不和合性 / サクラ属 / トランスクリプトーム / 植物防御反応 / 自己免疫反応 / 染井吉野
Outline of Annual Research Achievements

サクラ属の雑種不和合性に関与する遺伝子および分子メカニズムを明らかにすることを目的に、健全な実生および生育不全の実生においてRNA-seqを行い、発現遺伝子の網羅的解析(トランスクリプトーム)を行った。解析からは、生育不全となったサクラ属の雑種実生では、病原体に対する防御反応に関する遺伝子群が過剰発現していることが明らかとなった。特に、pathogenesis-related gene 1 (PR1)と相同性の高い遺伝子やLeucine-rich repeat受容体ドメインを持った遺伝子群などの高発現が、主に実生の胚軸において顕著に見られた。これらの防御反応は、gene onthology(GO)解析においても、生物的刺激に対する反応(GO:0009607, response to biotic stimulus)および防御反応(GO:0006952, defense response)等のGOのエンリッチメントとして示された。さらにGO解析からは、細胞サイクルや細胞の成長や分裂に関与する遺伝子の発現が、生育不全実生の葉(茎頂部位が含まれる)において低下することが示された。これらトランスクリプトームでみられた遺伝子発現の傾向は、RT-qPCRにおいても確認された。以上の結果から、サクラ属における雑種実生の生育不全は、防御関連の遺伝子の過剰発現により茎頂分裂組織を含む主軸の成長が妨げられることで引き起こされたと考察した。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Upregulation of defense-related gene expressions associated with lethal growth failure in the hybrid seedlings of Japanese flowering cherry2022

    • Author(s)
      Tsuruta Momi, Lian Chunlan, Mukai Yuzuru
    • Journal Title

      Tree Genetics & Genomes

      Volume: 18 Pages: 21

    • DOI

      10.1007/s11295-022-01552-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hybrid breakdown as a result of up-regulated expression of defense-related genes in the hybrid seedlings of Japanese flowering cherry2021

    • Author(s)
      Tsuruta Momi, Lian Chunlan, Mukai Yuzuru
    • Journal Title

      Proceedings of International Symposium on a Recent Progress in Forest Ecology and Management 2021

      Volume: - Pages: 47-53

    • Open Access
  • [Presentation] Hybrid breakdown as a result of up-regulated expression of defense-related genes in the hybrid seedlings of Japanese flowering cherry2021

    • Author(s)
      Tsuruta Momi, Lian Chunlan, Mukai Yuzuru
    • Organizer
      International Symposium on a Recent Progress in Forest Ecology and Management 2021
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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