2020 Fiscal Year Research-status Report
海洋中・深層における低次食物網構造の解明：細菌で結ぶマリンスノー食物網
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18K14515
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| Research Institution | National Institute of Polar Research |
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Principal Investigator |
佐野 雅美 国立極地研究所, 研究教育系, 特任研究員 (00814732)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | マリンスノー / 沈降粒子 / バクテリア / メタゲノム / 南大洋 / ゲルセジメントトラップ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
南大洋航海でゲルセジメントトラップにより水深50mから500mにかけた３層から採集したマリンスノー試料および動物プランクトン試料について、以下の3つを行った。
(1)水深50m, 200mより採集したマリンスノー各種のメタ18S解析のデータを解析した。得られた各分類群のリード数に基づきLEfSe (Linear Discriminant Analysis Effect Size) 解析を行ったところ、特定のタイプのマリンスノーに特徴的な分類群が検出された。メタ16S解析の結果についても現在解析中である。
(2)水深500mのゲルセジメントトラップ試料について次世代シーケンサーによるマリンスノー各種のメタ16S・18S解析を行った。形状に基づきマリンスノーをタイプ分けし、個々のマリンスノーからDNAを抽出、PCRした後、Miseqによるアンプリコンシーケンスを行った。得られた真核生物相および細菌叢のデータについては、これまで得られている他の水深の試料と合わせ解析を進めている。
(3)南大洋航海でゲルセジメントトラップ観測と並行してVMPSネットなど複数のプランクトンネットにより深度別に採集し、固定保存した動物プランクトン試料のソーティングを行なった。ゲルセジメントトラップ観測を行った測点の各深度における動物プランクトン各種の個体数密度を求め、これに基づき消化管内容物分析の対象とする動物プランクトン種を決定した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
マリンスノーの解析は予定通り進行している。その一方、新型コロナウイルス感染症の流行による影響で、実験予定等に大きな変更が生じたため、動物プランクトンの解析については遅れている。分析対象とする動物プランクトン種を決定したが、消化管内容物分析については遅れており、現在DNA抽出を進めている状態である。
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| Strategy for Future Research Activity |
分析対象種の消化管内容物のメタ16S,18S解析を行い、既に得られているマリンスノーの細菌叢・真核生物相と組成を比較し、動物プランクトン各種が摂食するマリンスノーのタイプを求め、本研究の目的であるマリンスノーと動物プランクトン間における食物網構造を明らかにする。
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルス感染症の流行による影響で、実験予定等に大きな変更が生じ、今年度予定していた次世代シーケンス解析を次年度に繰り越したため、その分の次年度使用額が生じた。そのため、次年度使用額はその次世代シーケンス解析の外注費およびその試料準備に必要な消耗品費に使用する予定である。
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Research Products
(4 results)
