• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Structural and functional analyses of a core complex of the bacterial flagellar export gate complex

Research Project

Project/Area Number 18K14638
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

木下 実紀  大阪大学, 生命機能研究科, 特任研究員(常勤) (30790985)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywords細菌 / 遺伝学 / 蛋白質 / 電子顕微鏡 / 感染症
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、べん毛III型タンパク質輸送ゲートコア複合体の機能構造を原子レベルで理解するため、コア複合体を形成する相互作用ネットワークを遺伝学的および生化学的に解析するとともに、X線結晶構造解析法によりFliP, FliQ, FliRの構造を原子レベルで解明することを目指している。本年度の主な成果は以下に示す。
1.PhoA fusion assayによりFliP, FliQ, FliRのトポロジー解析を行った結果、個々のサブユニット分子がモノマー状態から会合状態へ遷移する際にそれぞれの膜貫通ヘリックス領域が大きく構造変化することが示唆された。さらに、FliPのペリプラズム側に位置するループ構造および92番目のロイシン残基がFliPの機能発現に重要であることが判明した。
2.FliKのN末ドメインとC末ドメインをつなぐリンカー領域の欠失の大きさに依存してフックの長さは短くなる一方、FlhB-Cとの結合親和性が減少し、その結果べん毛タンパク質輸送装置の基質認識モードの切り替え効率が低下することが判明した。
3.FlhBのC末細胞質ドメイン (FlhB-C) がFlhAのC末細胞質ドメイン(FlhA-C)に結合するとFlhA-Cが閉じた構造から開いた構造に変化し、その結果べん毛タンパク質輸送装置はべん毛繊維形成に関与するタンパク質を輸送することが明らかとなった。
4.ATPaseであるFliIがFlhB-Cに結合してATP依存的に輸送ゲートを開閉すること、FlhBのN末細胞質領域とC末天然変性領域が輸送ゲートの開閉に重要な役割を果たすことが示唆された。

  • Research Products

    (12 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ユタ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ユタ大学
  • [Int'l Joint Research] 南京農業大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      南京農業大学
  • [Journal Article] The flexible linker of the secreted FliK ruler is required for export switching of the flagellar protein export apparatus2020

    • Author(s)
      Kinoshita Miki、Tanaka Seina、Inoue Yumi、Namba Keiichi、Aizawa Shin-Ichi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 838

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57782-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural Insights into the Substrate Specificity Switch Mechanism of the Type III Protein Export Apparatus2019

    • Author(s)
      Inoue Yumi、Ogawa Yuya、Kinoshita Miki、Terahara Naoya、Shimada Masafumi、Kodera Noriyuki、Ando Toshio、Namba Keiichi、Kitao Akio、Imada Katsumi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 27 Pages: 965~976.e6

    • DOI

      10.1016/j.str.2019.03.017

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mutational analysis of the C‐terminal cytoplasmic domain of FlhB, a transmembrane component of the flagellar type III protein export apparatus in Salmonella2019

    • Author(s)
      Inoue Yumi、Kinoshita Miki、Namba Keiichi、Minamino Tohru
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 24 Pages: 408~421

    • DOI

      10.1111/gtc.12684

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Directional Switching Mechanism of the Bacterial Flagellar Motor2019

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      Volume: 17 Pages: 1075~1081

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2019.07.020

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] FliK-Driven Conformational Rearrangements of FlhA and FlhB Are Required for Export Switching of the Flagellar Protein Export Apparatus2019

    • Author(s)
      Minamino Tohru、Inoue Yumi、Kinoshita Miki、Namba Keiichi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 202 Pages: e00637-19

    • DOI

      10.1128/JB.00637-19

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural and functional analyses of the flagellar transmembrane export gate complex of the Salmonella flagellar type III protein export apparatus.2019

    • Author(s)
      Kinoshita M, Miyata T, Kawamoto A, Kato T, Namba K, Minamino T.
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Salmonella Biology and Pathogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Autocatalytic cleavage of FlhB is required for conformational rearrangements of FlhA to switch export specificity of the flagellar protein export apparatus.2019

    • Author(s)
      Minamino T, Inoue Y, Kinoshita M, Namba K.
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Salmonella Biology and Pathogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Gating mechanism of the bacterial flagellar protein export apparatus (バクテリアべん毛タンパク質輸送装置のゲート機構).2019

    • Author(s)
      Kinoshita M, Namba K, Minamino T.
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] バクテリアべん毛タンパク質輸送装置のエネルギー共役機構.2019

    • Author(s)
      南野徹, 木下実紀, 難波啓一
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第45回討論会
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi