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2019 Fiscal Year Research-status Report

植物ゲノムを支える遺伝的冗長性を解析する技術基盤

Research Project

Project/Area Number 18K14678
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

菅野 茂夫  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (60726313)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords遺伝子重複 / 植物ゲノム / ライブラリ / ゲノム編集 / python
Outline of Annual Research Achievements

前年度に確立したベクター系およびgRNAを用いて,実際にいくつかのシステインリッチペプチドのタンデム重複遺伝子をシロイヌナズナにおいて破壊した.特に,名古屋大学田畑亮博士との共同研究では,特徴的な遺伝子発現パターンを示すCRPを破壊して,その表現型候補が得られていた.また,前年度に確立したシステムが他の植物にも利用可能なように,gRNAの設計プログラムはゼニゴケ,イネ,ポプラ,ホウレンソウにも拡張を行った.実際に,ホウレンソウでも遺伝子編集が可能か調べるために,ホウレンソウにおける効率的なインフィルトレーション法を確立した(田井ら,第61回植物生理学会年会).確立したインフィルトレーション法を活用して,ホウレンソウの一過的ゲノム編集を世界で初めて検出した.しかし,ホウレンソウにおけるゲノム編集の効率は低く,ベクター系を最適化する必要があると考えられた.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

実際に設計したgRNAに基づき,長鎖欠失による変異体作出が始まった点で進捗があるといえる.また,構築した方法論をほかの植物にも適用可能なことが示唆されている.

Strategy for Future Research Activity

今後はライブラリーをシロイヌナズナに導入してゲノム編集個体をハイスループットに作製していく予定である.効率が想定より高くないこともあるため,ベクターの効率化も並行して行っていく予定である.

Causes of Carryover

2019年度に赴任した産業技術総合研究所が設備に恵まれており,設備投資が不要になったことと,2018年度に遅れが生じてしまった分のゲノム編集個体のスクリーニング用消耗品が2020年度に必要になると考えられたため.

  • Research Products

    (1 results)

All 2020

All Presentation (1 results)

  • [Presentation] ヒユ科植物に対するアグロインフィルトレーション法2020

    • Author(s)
      田井超洋,菅野茂夫,景山達也,深尾陽一朗
    • Organizer
      第61回植物生理学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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