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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Functional analysis of genes related to early calcification processes of scleractinian corals

Research Project

Project/Area Number 18K14745
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

安岡 有理  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (70724954)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2023-03-31
Keywords刺胞動物 / 変態 / バイオミネラリゼーション / 発生 / 進化 / 地球温暖化 / 海洋酸性化
Outline of Annual Research Achievements

本年度は本研究をほとんど遂行できなかったため、以下に今後の研究の展開に関する計画を記す。
【サンゴ胚への顕微注入実験による遺伝子機能解析】これまで行った水温・pHに対するサンゴ幼生・ポリプの耐性実験結果を論文発表する。
【サンゴPKSの機能解析】石灰化においてポリケチド合成酵素(PKS)が担う機能の進化的保存性を調べるため、サンゴPKS遺伝子の機能を脊椎動物モデル(メダカ)で検討する。メダカのPKS変異体は耳石形成不全の表現型を示すので、サンゴPKS遺伝子の過剰発現によるレスキュー実験を行い、刺胞動物から脊椎動物まで保存された石灰化メカニズムが存在するのかを明らかにする。
【サンゴ変態期におけるRNA-seq解析】ウスエダミドリイシサンゴ(Acropora tenuis)のプラヌラ幼生および変態初期のポリプを用いたRNA-seqデータから、初期ポリプの成長過程において顕著に発現が増減する遺伝子を割り出し、既知の石灰化関連遺伝子のプロファイルと比較することで石灰化関連遺伝子を網羅的に同定する。また、Acropora sp.1のRNA-seqデータからトランスクリプトームアセンブリを行って遺伝子モデルを構築し、A. tenuis同様に石灰化に関わる遺伝子の発現量解析を実施する。産卵時期が異なるAcropora種間での保存性を調べることで、海水温などの環境に対して頑健な石灰化メカニズムの根幹を解明する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Tissue-specific expression of carbohydrate sulfotransferases drives keratan sulfate biosynthesis in the notochord and otic vesicles of Xenopus embryos2023

    • Author(s)
      Yasuoka Yuuri
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 11 Pages: 957805

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.957805

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 発生ゲノミクスで探る脊椎動物の進化過程2023

    • Author(s)
      安岡有理
    • Organizer
      生命誌 研究者セミナー
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオームから見たシロアゴガエルミトコンドリアゲノム進化の背景2023

    • Author(s)
      安岡有理
    • Organizer
      広島大学両生類研究センターバイオリソース棟落成記念シンポジウム
  • [Presentation] 動物胚初期発生における遺伝子制御ネットワークとその進化に関する研究2022

    • Author(s)
      安岡有理
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
    • Invited
  • [Presentation] ツメガエルを用いたミトコンドリアゲノム編集への挑戦ー第2章2022

    • Author(s)
      安岡有理、岡﨑康司
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
  • [Presentation] 初期胚における遺伝子発現の揺らぎと進化の関係を探る2022

    • Author(s)
      安岡有理
    • Organizer
      第24回日本進化学会年会
  • [Presentation] Fluctuation of gene expression levels in early embryos is correlated to environmental and evolutionary responses2022

    • Author(s)
      Yuuri Yasuoka, Chikara Furusawa, Yasushi Okazaki
    • Organizer
      第55回日本発生生物学会年会
  • [Remarks] Yuuri Yasuoka, Ph. D.

    • URL

      https://yuuriyasuoka.wordpress.com/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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