2021 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of heat-response gene regulation through norvel nuclear body by containing the noncoding RNA
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18K14899
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小野口 玲菜 (水谷玲菜) 東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 核内構造体 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
熱ストレスへ正常に応答することは生物の生存において重要であり、熱ストレスへの応答異常は神経変性疾患やがんなど様々な疾患の原因の一端となっている。 申請者はこれまでに長鎖非コードRNAに着目して、ストレス応答機構について研究を行ってきた。その過程で、通常は核スペックルと呼ばれる核内構造体に局在化している長鎖非コードRNA, MALAT1が熱ストレスに応答して新規核内構造体(MALAT1含有新規核内構造体と命名)に局在変化するという新しい現象を発見した。 本研究では、MALAT1含有新規核内構造体を介した遺伝子発現の制御機構を解明し、熱ストレス応答におけるこの構造体の生理的意義を明らかにすることを目的とした。
昨年度までに取得した、網羅的にオープンクロマチン領域を同定する手法であるATAC-seq解析のデータを詳細に解析した結果、MALAT1依存的に変化する熱 応答性のオープンクロマチン領域が同定された。このことはMALAT1が熱ストレス時にクロマチン構造の制御に関与することを示唆している。今年度はさらに詳細にこのデータを解析し、MALAT1依存的に熱応答遺伝子の発現制御に関与しうる転写因子の候補を見出した。
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