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2020 Fiscal Year Research-status Report

耐性菌パンデミックの回避に向けた細菌薬剤排出ポンプの解析と阻害剤開発

Research Project

Project/Area Number 18K14902
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山崎 聖司  大阪大学, 高等共創研究院, 准教授 (70757301)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords耐性菌 / 感染症 / 排出ポンプ / 細菌 / 抗生物質 / 抗菌薬 / 薬剤耐性 / 多剤耐性
Outline of Annual Research Achievements

世界中の医療従事者が直面している薬剤耐性菌感染症の克服、および大規模な耐性菌パンデミックの回避に向けて、薬剤耐性化に大きく寄与している細菌の薬剤排出ポンプとその発現制御因子に着目した分子標的創薬を実現するための技術基盤を構築する。

具体的には、実際に申請者の研究から、薬剤排出ポンプが薬剤耐性だけでなく病原性発現等にも関わることが分かってきており、薬剤排出ポンプの機能の全貌を解明することが重要な課題となってきたため、関与する環境因子を含めた薬剤排出ポンプの発現制御ネットワークおよび生理的役割を明らかにする。一方、こちらも申請者の研究から、排出ポンプの薬剤認識機構(Nature, 2011)および阻害剤感受性決定因子(Nature, 2013)が明らかとなったが、依然として臨床的に有効な阻害剤は得られていないため、これまでに得られたタンパク質構造情報を利用した効率的な探索手法によって、排出ポンプ新規阻害剤を開発する。

今年度は、臨床分離株の公開ゲノムデータと実験で得た排出ポンプデータを組み合わせ、薬剤耐性緑膿菌に存在する共通の変異を複数発見した。特に多くの菌株で見られた3つの点変異は、アミノ酸変異を伴わず(サイレント変異) 、codon usageは元のコドンと比較して高くなっていることが判明した。アミノ酸変異を伴わない点変異(サイレント変異)による新たな薬剤耐性化メカニズムの解明、迅速な耐性菌判定手法の実用化に大きく貢献できると考えている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

今後の新規創薬、迅速な耐性菌判定手法の実用化において重要な情報となる、薬剤耐性緑膿菌に存在する共通の変異を複数発見できたため。

Strategy for Future Research Activity

今回得られた薬剤耐性緑膿菌に存在する共通変異の詳細情報を用いることで、効果的な排出ポンプ新規阻害剤の開発、新たな薬剤耐性化メカニズムの解明等を進める。また、公開データを活用した排出ポンプの変異情報の取得を引き続き行い、実用化に向けたデータ解析を進める。

Causes of Carryover

コロナ対策で実験量削減のため。収束次第再開する。

  • Research Products

    (3 results)

All 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Identification of Genetic Variants via Bacterial Respiration Gas Analysis2020

    • Author(s)
      Koga Naoki、Hosomi Takuro、Zwama Martijn、Jirayupat Chaiyanut、Yanagida Takeshi、Nishino Kunihiko、Yamasaki Seiji
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 11 Pages: 581571

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.581571

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 緑膿菌の薬剤耐性獲得阻止を目的とした、薬剤排出ポンプMexBとポンプ機能阻害ABI-PPの結合様式の解析2020

    • Author(s)
      古閑 修輝, 山崎 聖司, 櫻井 啓介, 中島良介, 山口 明人, 西野 邦彦
    • Organizer
      大阪大学 産業科学研究所 第76回学術講演会
  • [Presentation] 細菌が排出する揮発性成分の分析による遺伝的性質の同定2020

    • Author(s)
      山崎聖司
    • Organizer
      第3回COI学術交流会

URL: 

Published: 2021-12-27  

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