2018 Fiscal Year Annual Research Report
自閉スペクトラム症多発家系の大規模エクソーム解析に基づく疾患脆弱性因子の同定
| Project/Area Number |
18K15512
|
|---|
| Research Institution | Nagoya University |
|---|
Principal Investigator |
木村 大樹 名古屋大学, 医学系研究科, 寄附講座助教 (30612783)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2019-03-31
|
| Keywords | エクソーム / 自閉スペクトラム症 / ネットワーク解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、研究代表者が構築したエキソーム解析体制とこれまてに候補遺伝子内に疾患脆弱性変異を同定した経験を基に、自閉スペクトラム症の新規疾患脆弱性変異を同定するため、①日本人自閉スペクトラム症多発家系のゲノムサンプリング、②患者に加え健常家族も含めた家系全体のエキソーム解析、③家系解析に よりde novo 変異に加え患者間で共有する変異の抽出、④in silico解析による疾患脆弱性変異を基にした自閉スペクトラム症発症に関わる遺伝子ネットワーク 障害の特定、を実施する予定としている。平成30年度においては、自閉スペクトラム症多発17家系のエクソーム解析が終了し、構築したエクソーム解析パイプラインを用いて変異が検出できることを、サンガー法を用いて確認した。その後、検出された変異のクオリティを評価した上で、頻度が1%未満で、かつタンパク質機能に強い影響を与える変異を選択することで、疾患関連ゲノム変異(患者間で共有される変異、de novo変異)の抽出を行なった。その結果、神経発達障害データベースやSFARIデータベースで自閉スペクトラム症の発症に強い影響力を持つことが判明している遺伝子内において、疾患関連ゲノム変異を複数同定した。さらに、同定した疾患関連ゲノム変異は、神経発達に関連する遺伝子ネットワーク内に存在することが判明し、病態解明への手がかりを得ることが期待された。既に、追加の自閉スペクトラム症多発家系のサンプリングも行なっており、引き続きサンプリングを実施している。
|
Research Products
(11 results)
-
-
[Journal Article] Assessment of a glyoxalase I frameshift variant, p.P122fs, in Japanese patients with schizophrenia.2018
Author(s)
Ishizuka K, Kimura H, Kushima I, Inada T, Okahisa Y, Ikeda M, Iwata N, Mori D, Aleksic B, Ozaki N.
-
Journal Title
Psychiatr Genet
Volume: 28
Pages: 90-93
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Comparative Analyses of Copy-Number Variation in Autism Spectrum Disorder and Schizophrenia Reveal Etiological Overlap and Biological Insights.2018
Author(s)
Kushima I, Aleksic B, Kimura H, Arioka Y, Yoshimi A, Takasaki Y, Yu Y, Nakamura Y, Yamamoto M, Iidaka T, Iritani S, Inada T, Ogawa N, Shishido E, Torii Y, Kawano N, Omura Y, Yoshikawa T, Uchiyama T, Yamamoto T, Ikeda M, Hashimoto R, Yamamori H, Yasuda Y, Someya T, Itokawa M, Arai M, Iwata N, Ozaki N
-
Journal Title
Cell Rep
Volume: 24
Pages: 2838-2856
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
-
[Journal Article] Single-cell trajectory analysis of human homogenous neurons carrying a rare RELN variant.2018
Author(s)
Arioka Y, Shishido E, Kubo H, Kushima I, Yoshimi A, Kimura H, Ishizuka K, Aleksic B, Maeda T, Ishikawa M, Kuzumaki N, Okano H, Mori D, Ozaki N.
-
Journal Title
Transl Psychiatry
Volume: 8
Pages: 129
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Rare loss of function mutations in N-methyl-D-aspartate glutamate receptors and their contributions to schizophrenia susceptibility.2018
Author(s)
Yu Y, Lin Y, Takasaki Y, Wang C, Kimura H, Xing J, Ishizuka K, Toyama M, Kushima I, Mori D, Arioka Y, Uno Y, Shiino T, Someya T, Egawa J, Usami M, Kodaira M, Yoshimi A, Oya-Ito T, Aleksic B, Ohno K, Ozaki N.
-
Journal Title
Transl Psychiatry
Volume: 8
Pages: 61
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
