Chimeric transcripts between HTLV-1 and host genome in patients with adult T-cell leukemia-lymphoma

2019 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 18K16122
• Research Institution: Saga University
• Principal Investigator: 勝屋 弘雄 佐賀大学, 医学部, 助教 (80632041)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 成人T細胞白血病・リンパ腫 / キメラトランスクリプト / 次世代シークエンス解析

Outline of Annual Research Achievements

HTLV-1組み込み部位特異的に生じるウイルスとヒトゲノムのキメラトランスクリプトによるクローン性増殖への関与を検証するため、in vitroで機能解析を実施した。
HTLV-1を導入した293T細胞に放射線照射をした後、Jurkat細胞と共培養をした。ウイルス蛋白であるTax陽性細胞をソーティングし、16週間培養を行った。それらの細胞からDNAを抽出しHTLV-1組み込み部位を指標としたクローナリティー解析では、いくつかの感染細胞のクローン性増殖を認めた。RNA-seqでは、増殖した感染クローンで、組み込み部位特異的なキメラトランスクリプトが検出された。16週間培養後の細胞を用いて限界希釈によるHTLV-1感染細胞のクローニングを施行した。クローニングされた細胞株を用いて細胞増殖解析をしたところ、HTLV-1非感染細胞株と比較して、細胞増殖速度が亢進しているものがみられた。これらよりウイルスとヒトゲノムのキメラトランスクリプトが細胞増殖に関与している可能性が示唆された。

Research Products

• [Journal Article] HIV-1 DNA-capture-seq is a useful tool for the comprehensive characterization of HIV-1 provirus (2019)
  • Author(s): Iwase Saori C.、Miyazato Paola、Katsuya Hiroo、Islam Saiful、Yang Benjy Tan Jek、Ito Jumpei、Matsuo Misaki、Takeuchi Hiroaki、Ishida Takaomi、Matsuda Kouki、Maeda Kenji、Satou Yorifumi
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 9 Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41598-019-48681-5
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The Nature of the HTLV-1 Provirus in Naturally Infected Individuals Analyzed by the Viral DNA-Capture-Seq Approach (2019)
  • Author(s): Katsuya Hiroo、Islam Saiful、Tan Benjy Jek Yang、Ito Jumpei、Miyazato Paola、Matsuo Misaki、Inada Yuki、Iwase Saori C.、et al.
  • Journal Title: Cell Reports Volume: 29 Pages: 724～735.e4
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.016
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] HTLV-1 contains a high CG dinucleotide content and is susceptible to the host antiviral protein ZAP (2019)
  • Author(s): Miyazato Paola、Matsuo Misaki、Tan Benjy J. Y.、Tokunaga Michiyo、Katsuya Hiroo、Islam Saiful、Ito Jumpei、Murakawa Yasuhiro、Satou Yorifumi
  • Journal Title: Retrovirology Volume: 16 Pages: -
  • DOI: 10.1186/s12977-019-0500-3
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] The presence and possible role of virus-host chimeric transcripts in adult T-cell leukemia-lymphoma. (2019)
  • Author(s): Katsuya H, Miyazato P, Islam S, Tan BJY, Inada Y, Matsuo M, Ueno T, Tokunaga M, Hata H, Yamagishi M, Fujisawa J, Watanabe T, Uchimaru K, Utsunomiya A, Kimura S, Satou Y.
  • Organizer: 62nd Annual Meeting of American Society of Hematology
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ウイルスDNA カプチャーシークエンスはウイルス関連ヒト悪性腫瘍の病原性解明に有用である：HTLV-1 を例として (2019)
  • Author(s): 勝屋弘雄、イスラムサイフル、タンベンジー、伊東潤平、宮里パオラ、内山良一、畑裕之、佐藤和雄、八木下尚子、新谷奈津美、上野孝治、野坂生郷、徳永雅仁、山岸誠、渡邉俊樹、内丸薫、藤澤順一、宇都宮與、山野嘉久、佐藤賢文
  • Organizer: 第17 回日本臨床腫瘍学会学術集会
• [Presentation] The nature of HTLV-1 provirus in naturally infected individuals analyzed by viral DNA-capture-seq approach. (2019)
  • Author(s): 勝屋弘雄、イスラムサイフル、タンベンジー、伊東潤平、宮里パオラ、内山良一、畑裕之、佐藤和雄、八木下尚子、新谷奈津美、上野孝治、野坂生郷、徳永雅仁、山岸誠、渡邉俊樹、内丸薫、藤澤順一、宇都宮與、山野嘉久、佐藤賢文
  • Organizer: 第59回日本リンパ網内系学会総会
• [Presentation] The presence and possible role of virus-host chimeric transcripts in HTLV-1-infected cells. (2019)
  • Author(s): 勝屋弘雄、宮里パオラ、イスラムサイフル、タンベンジー、稲田由紀、松尾美沙希、上野孝治、徳永雅仁、畑裕之、山岸誠、藤澤順一、渡邉俊樹、内丸薫、宇都宮與、木村晋也、佐藤賢文
  • Organizer: 第81回日本血液学会総会