2019 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of adipocyte-specific transcriptional regulation by analyzing three-dimensional chromatin interactions through Promoter Capture Hi-C method
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18K16192
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
青山 倫久 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (50645538)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 脂肪細胞 / 転写制御 / クロマチン3次元構造解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
脂肪細胞分化において重要な役割を果たすPPARγによるC/EBPα遺伝子の転写制御機構は不明であった。現在までに我々はChIP-seq解析によりC/EBPα遺伝子の下流の遠位領域にPPARγ結合部位のクラスターを同定し、3C法による解析でC/EBPα遺伝子のプロモーターと遠位領域との間に分化により増強する近接関係を認め、同領域間のクロマチンループの形成がC/EBPα遺伝子の転写制御に重要である可能性を明らかにしてきた。本研究ではさらにゲノムワイドにプロモーター・エンハンサー間の近接関係を解析する目的で脂肪細胞においてPromoter capture Hi-C法による解析を行い、3C法で見出していたCEBPα遺伝子のプロモーターと下流の遠位領域との近接関係が確認されたことに加えて、既存の手法のみでは検出できなかった新たなゲノム領域との間に近接関係が存在することが示唆された。
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Research Products
(1 results)
